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基因组DNA的分离与纯化
一、酚抽提法的原理
以含EDTA、SDS的裂解液裂解细胞,经蛋白酶K消化后,用PH8.0的Tris 饱和酚抽提蛋白质,离心后取上层水相,无水乙醇沉淀DNA。
二、技术路线
破 膜
提 纯
沉淀、洗涤
细胞膜碎片,细胞器,脂、蛋白质,DNA,RNA
去除脂、
蛋白质
浓缩DNA、
去盐杂质
1.低渗去除红细胞
2.裂解白细胞
3.酚抽提
4.无水乙醇沉淀
5.DNA沉淀的洗涤与干燥
6.DNA溶解与电泳鉴定
三 结果
琼脂糖凝胶电泳鉴定
EB可嵌入到碱基平面,使核酸在 UV 激发下发出桔红色荧光。
三 结果
琼脂糖凝胶电泳鉴定
The End
裂解液的作用
裂
解
液
EDTA
SDS
Tris -HCl
DNA酚抽提法示意图
酚的作用
酚可以使蛋白质变性沉淀、抑制DNA酶活性。
PH8.0的Tris溶液可以使抽提出的DNA进入水相 。
DNA酚抽提法示意图
蛋白酶K的作用
水解组蛋白,促进DNA与组蛋白的分开。
DNA的沉淀
无水乙醇沉淀
沉淀前往往加入NaAc等盐离子,作用是中和核酸分子表面的负电荷,有助于分子之间的聚集。
无水乙醇可以吸收分子之间的水,使DNA沉淀析出,无水乙醇使用前冰冻,可以减少DNA沉淀析出过程释放热量对DNA的损伤。
TE
10mmol/L Tris-HCl
1mmol/L EDTA
上样缓冲溶液(6 × 或10×)
溴酚蓝(电泳指示剂,约相当于300bpDNA)
二甲苯氰(电泳指示剂,约相当于4000bpDNA)
甘油/蔗糖(增加DNA溶液的密度)
0.5~1.4%琼脂糖凝胶
水相的吸取
SDS(去垢剂)
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