蛋白质工程要点.docVIP

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蛋白质 1.蛋白质的功能:1.催化 2.调节 3.受体 4.转运 5.贮存 6.运动 7.结构成分 8防御 9异常功能 2.氨基酸构型:指一个分子中原子的特定空间排布,不同的构型如果没有共价键的破坏是不能互变的 3.氨基酸构象:指具有相同的结构式和相同的构型的分子在空间里可能的多种状态,构象形态间的改变不涉及共价键的破坏 4.氨基酸的等电点:在某一PH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性,此时溶液的PH值称为该氨基酸的等电点 等电点:(PI)在某一PH溶液中,氨基酸解离成阴离子和阳离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液中的PH值称为氨基酸的等电点。 (1)PHPI 酸性,解离出正电荷 阳离子 (2)加酸 解离出正电荷 5.肽键:由一个氨基酸的a-羧基与别一个氨基酸的a-氨基脱水缩合而形成的化学键,肽键中的C-N键具部分双键性质,不能自由旋转 6.肽单位:由于局部双键性质,肽键连接的基团处于同一平面,具有确定的键长和键角,是多肽链中的刚性结构,称为肽单位 7.肽平面:肽键具有一定程度的双键性质,参与肽键的六个原子C、H、O、N、Cα1、Cα2不能自由转动,位于同一平面,此平面就是肽平面,也叫酰胺平面。 8.蛋白质一级结构:多肽链中氨基酸的排列顺序,由遗传密码的排列顺序决定,一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学功能的基础,主要化学键是肽键 9.Anfinsen原理:决定蛋白质分子高级结构的全部信息都包含在一级结构即多肽链的氨基酸序列中,蛋白质的一级结构决定了二级、三级等高级结构,这就是著名的Anfinsen原理 蛋白质二级结构:蛋白质分子中某一段肽键的局部空间结构,即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象 10.蛋白质的二级结构:蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构,即该肽链主链骨架原子的相对空间位置,并不涉及氨基酸残基侧链的构象。主要化学键:氢键 11.二面角:两相邻酰胺平面之间,能以共同的Ca为定点而旋转,绕Ca-N键旋转的角度称∮角,绕C-Ca键旋转的角度称φ角,∮和φ称作二面角,亦称为构象角,决定相邻肽基的几何位置 12.拉氏构象图:以肽链的各a-碳的二面角∮为横坐标,φ为纵坐标,在坐标图中标出,该坐标图称拉氏构象图,广泛用于检测实验测定和计算机模型构造的各种蛋白质结构的合理性 13.盐析:蛋白质在高浓度中性盐溶液中会沉淀析出,称为盐析,常用的盐为硫酸铵,不同蛋白质所需的盐离子浓度不同,可调节硫酸铵浓度使蛋白质在不同阶段沉淀下来,称为硫酸铵分级沉淀法 14.等电点沉淀法:在一定PH值下,蛋白质所带电荷为零,此时PH值为该蛋白质的等电点,蛋白质在等电点时分子向排斥力消失蛋白质沉淀,因此可以通过调节溶液PH值使蛋白质分开 15.蛋白质的超二级结构:一级序列上相邻的二级结构在三维折叠中也靠近,彼此按特定的几何排布形成简单的组合,这些组合单位称超二级结构或结构模体,它们是三级结构的建筑模块 16.超二级结构的四种基本组合形式:a-a,B-a-B,B-B,B连角-转角 27.蛋白质的三级结构及结构域:二级结构和结构模体(超二级结构)以特定的方式组织连接,在蛋白质分子中形成两个或多个在空间上可以明显区分的三级折叠实体,称为结构域 18.蛋白质的三级结构:结构域在三维空间中以专一的方式排布组合,或者二级结构,结构模体在空间中的进一步协同盘曲折叠形成的包括主链和侧链在内的专一结构为蛋白质的三级结构,主要作用力为疏水作用 按结构域将蛋白质分类:a型结构域,B型结构域,a/B型结构域,无规则/富含二硫键和金属离子型 a型结构域—--四螺旋束:烟草花叶病毒的外壳蛋白,肌蚯蚓血红蛋白,人生长激素 B型结构域上下桶式结构域:视黄醇结合蛋白 a/B型结构域TIM桶式折叠结构域:磷酸丙糖异构酶、受体 19.蛋白质的等电点:在某一PH值溶液中,蛋白质酸性基团和碱性基团的解离程度相当蛋白质分子所带正负电荷相等,净电荷为零,此时溶液的PH值称为蛋白质的等电点 PHPI 正电 PHPI 负电 20.沉淀:蛋白质分子相互聚集而从溶液中析出的现象称为~ 21.蛋白质的变性:天然蛋白质分子受到某些物理因素或化学因素影响时,会引起蛋白质天然构象的破坏,导致生物活性的降低或完全丧失,这一过程称为变性 22.分子伴侣:分子伴侣是细胞中一大类蛋白质,是由不相关的蛋白质组成的一个家系,它们介导其他蛋白质的正确装配,但自己不成为最后功能结构的组分,广泛存在于生物体内,分子伴侣主要属于三类高度保守的蛋白质家族 23.蛋白质折叠病:由于蛋白质的三维空间结构异常,导致病蛋白分子通过分子间作用感染正常蛋白质而致病,致病蛋白质分子与正常蛋白质分子的构成完全相同,只是空间结构不同,如疯牛病、老年

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