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第一节:基本概念
第二节:原核生物RNA的转录
第三节:真核生物RNA的转录
第四节:原核生物RNA转录后加工
第五节:真核生物RNA转录后加工
第六节:真核生物转录产物中内含子的去除
第一节 基本概念
转录(transcription)
有义链 (sense strand) 、编码链 (coding strand)、非模板链
反义链 (antisense strand)、模板链 (template strand)
RNA的类别
?信使RNA(messenger RNA,mRNA):在蛋白质合成中起模板作用;
?核糖体RNA(ribosoal RNA,rRNA):与蛋白质结合构成核糖体(ribosome),核糖体是蛋白质合成的场所;
?转移RNA(transfer RNA,tRNA):在蛋白质合成时起着携带活化氨基酸的作用。
RNA合成特征:
前体是ATP、UTP、CTP、GTP
合成方向5’-3’
一个转录区内,一般只有一条DNA链可以被转录
RNA聚合酶与DNA聚合酶不同
DNA和RNA合成的比较
* 转录的基本过程(P66):
模板识别、转录起始、转录延伸和终止
真核细胞和原核细胞中模板的识别有什么不同?
第二节 原核生物RNA的转录(RNA Transcription in prokaryots)
一、RNA聚合酶(全酶、核心酶)
二、启动子
三、转录起始
四、转录延伸
E. coli RNA polymerase(P67)
负责起始和延伸
负责起始
36.5 KD
36.5 KD
151 KD
155 KD
11 KD
70 KD
全酶和启动子的牢固结合( α 亚基)
未知( β’亚基)
催化磷酸二酯键形成( β亚基)
识别启动子,从正确位置启动转录(σ因子作用位点)
由于各亚基的功能,使全酶本身含有五个功能位点
有义DNA链结合位点( β’亚基提供)
DNA/RNA杂交链结合位点(β亚基提供)
双链DNA解链位点(前端 α亚基提供)
单链DNA重旋位点(后端α亚基提供)
识别启动子,从正确位置启动转录(σ因子作用位点)
转录的真实性取决于特异的转录起始位点 (P70)
只有带σ因子的全酶才能专一结合于DNA上的启动子位点
σ因子的作用只是起始转录,一旦转录开始,它就脱离了起始复合物,而由核心酶负责转录延伸
启动子、转录单元、转录起点(P71)
RNA聚合酶与启动子区的识别方式:氢键互补(P72)
Pribnow框:-10,RNA聚合酶牢固结合位点
Sextama框:-35,RNA聚合酶初始结合位点
依靠σ因子识别该位点
RNApol 在DNA上结合区域的鉴定
DNase 法----------40bp
足迹法(footprinting)结果相对准确+20 ~ -50(-40),大约 60 ~ 70 bp
转录的起始过程
σ
核心酶
12~17bp
第三节 真核生物RNA转录
RNA Transcription in Eukaryots
一、真核生物 RNA pol
二、真核生物启动子
三、转录终止
四、抗转录终止
RNApolⅠ
RNApol Ⅱ
RNApol Ⅲ
对 α - 鹅膏蕈碱的敏感性
最不敏感 (动、植、昆)
最敏感
不同种类的敏感性不同
位置
核仁
所占比例最大
核质
核质
转录产物
rRNA(5.8S、18S、 28S)
hnRNA、snRNA
tRNA、5S rRNA、Alu序列,部分 snRNA
一、真核生物的三种RNApol(P69)
二、真核生物启动子区的结构(P75):
-25至-35bp的Hogness区(TATA box)
-70至-80bp的CCAAT(CAAT box)
-80至-110bp的GCCACACCC/GGGCGCG(GC box)
上游启动子元件UPE
下降突变、上升突变 (P75)
增强子(enhancer)
TATA区控制转录精确起始
CAAT区和GC区控制转录起始频率
原核生物和真核生物mRNA比较(P78)
原核生物mRNA半衰期短
原核生物——多顺反子;真核生物——单顺反子
原核生物mRNA无5’端帽子结构,3’端没有或只有很短的poly(A)尾;真核生物mRNA有5’端鸟苷帽(鸟苷酸转移酶),绝大多数真核生物3’端有poly(A)尾【 poly(A) 合成酶】
帽子结构使mRNA免遭核酸酶破坏; poly(A)尾是mRNA由细胞核进入细胞质所必需形式
mRN
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