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真核生物RNA 聚合酶的行为 1、转录时,按5’ 3’方向合成RNA链; 2、底物为4种三磷酸核苷酸:ATP,GTP, UTP 和CTP; 3、不需要引物; 4、需要其他起始蛋白的存在,聚合酶才能 与启动子结合并诱导起始; 5、RNA 与反义模板链互补。 RNA Pol II 基因:启动子和增强子 启动子 上游调控元件(URE) 基本启动元件( TATA box 和 Initiator elements) :主要决定转录起始点的位置,并且只在一个相当低的水平启动转录的起始。 上游调控元件,习惯上,将TATA区上游的保守序列,如GC框和CAAT框, 在增加转录的起始效率上起重要的作用。 增强子(Enhancer) 增强子的特性 原核生物与真核生物mRNA的特征比较 1、原核生物mRNA的特征 原核生物mRNA的半衰期短 许多原核生物mRNA以多顺反子的形式存在 原核生物mRNA的5’端无帽子结构,3’端没有或只有较短的poly(A)结构 2、真核生物mRNA的特征 凡是编码功能蛋白的真核基因都通过RNA聚合酶II进行转录,真核基因几乎都是单顺反子。 真核生物mRNA的5’端存在“帽子”结构 绝大多数真核生物mRNA具有poly(A)尾巴 * 生命科学学院 * 中度敏感 tRNAs, U6snRNA 和其它的小RNAs 核质 RNA Pol Ⅲ 特别敏感 mRNA前体 核质 RNA PolⅡ 不敏感 大多数 rRNAs 核仁 RNA Pol I 对 ?-amanitin的敏感性 合成的RNA类型 位置 类型 三种真核细胞RNA聚合酶的性质 RNA Pol II 调控元件 启动子 上游调控元件 增强子(Enhancers) RNA Pol II 存在于核质中 转录所有编码蛋白质的基因和大多数核内小RNA。 RNA Pol Ⅱ转录的前体mRNAs需要通过加帽、加尾和剪接等处理过程。 典型的RNA Pol II基因 大多数启动子有一个被称为 TATA box 序列,它在转录起始点上游- 25~ -35 bp处。 使RNA Pol II 能确定起始位点并能准确地起始转录,并且有助于DNA双链的解开。 TATA框的序列是非常重要的,在TATA框和转录起点之间的序列是无关紧要的,但它们之间的距离是重要的。转录起始点在50%左右是A。 PyAPy CAT 启动子 一些真核生物的基因包含一个启动元件[ initiator element (Inr)]来替代 TATA框。 也有一些基因两者都没有,通常它们的转录效率是很低的。 启动子 CAAT box: 在上游大约–75 bp处, 被 CTF 家族因子识别, CP1 CP2, C/EBP ACF. GC box or SP1 box (GGGCGG): -90bp, 被 SP1识别。 Octamer sequence (TGCAAAGC): Oct-1 (ubiquitous) and Oct-2 (lymphoid cells). 上游调控元件(URE) 增强子:它是一个顺式作用元件,能够增加真核生物启动子的利用,并且能在相对于启动子的任一方向和任一位置(上游或下游)起作用。 一是它与启动子的相对位置无关。增强子无论在启动子的上游或是下游,甚至相隔几千个碱基对,只要存在于同一DNA分子上都能对其作用。如果邻近有几个启动子,增强子总是优先作用于最近者。 二是它无方向性。 三是增强子具有组织特异性,它往往优先或只能在某种类型的细胞中表现功能。 增强子(Enhancer) 转录因子和 RNA PolⅡ的起始 RNA pol II转录因子的三种类型 常规的(基本的)转录因子:所有起动子都需要。 上游因子: 结合到保守顺列,但不进行调控 (普遍存在的). 可诱导的因子: 与应答元件相结合,在特定的时间或组织合成或激活。 管家基因:因子 1 + 2 (组成型表达) 常规的(基本的)转录因子:(TFIIx): 所有起动子都需要; + RNA pol = 基本的转录的装置。 TFIID:是一个多蛋白 质复合物,包括TBP, 其它的蛋白被称为 TAFIIs。 TBP 是唯一的结合 到TATA box的蛋白质。 TAFIIs: TBP相关因子 TBP is a general transcription factor for Pol positioning (in SL1, TFIID TFIIIB) * 生命科学学院
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