2-蛋白质化学程序.ppt

蛋白质中常见氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 氨基酸的结构 蛋白质分子构象主要靠非共价键维持，如氢键、范德华力、疏水作用力、离子键。在某些蛋白质中二硫键、配位键也参与维持构象。 范德华力 实质是静电引力； 氢键 维持蛋白质分子主链骨架的构象； 疏水作用力 是由于氨基酸疏水侧链被极性的水分子排斥，而被迫彼此接近产生的作用力。 离子键 又称盐键或盐桥，是指正负离子之间的静电吸引，如血红蛋白分子中肽链间存在盐键。 （三） 维持蛋白质分子构象的化学键 氢键生成：当氢原子与电负性较强的原子，如N，O组成N－H ，O－H基团时，其键间的电荷分布不均．氢原子变成近乎氢正离子状态。此时再与另一电负性很强的原子相遇时，即发生静电吸引。因此，结合可视为以H 离子为桥粱而形成的，故称为氢键。 A－H…B 其中A，B 是氧、氮或氟等电负性大且原子半径比较小的原子。生成氢键时，给出氢原子的A叫做氢供体，与氢原子配位的电负性较大的原子B 叫氢受体。 氢供体 氢受体 （四）蛋白质的二级结构 多肽链有规律的盘绕、折叠而形成的空间结构（即多肽链主链骨架中局部的规则构象 ）叫蛋白质二级结构。包括?-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲。维持二级结构的化学键为氢键。 1. α-螺旋 Pauling和Corey根据氨基酸和小肽的X-射线晶体衍射图谱，于1951提出了α-螺旋结构。不久，Perutz利用X-射线衍射技术证实了在α-角蛋白（α-keratin）中存在α-螺旋，见图。 α-螺旋具有下列特征： 多肽链主链骨架围绕同一中心轴呈螺旋式上升，形成螺旋结构。每圈包含3.6个氨基酸残基，螺距为0.54nm，因此，每个氨基酸残基围绕螺旋中心轴旋转100o，上升0.15nm。 相邻螺旋之间靠链内氢键连接（即一个氨基酸残基（n）的N-H的H与前第四个（n+4）残基的C=O之间形成的氢键（N-H…O=C）。氢键的方向与α-螺旋轴的方向几乎平行。 氢键封闭的环共包含13个原子，故典型的α-螺旋又称3.613螺旋。每个肽键均参与氢键形成。因此，尽管氢键的键能不大，但大量氢键的累加效应使α-螺旋成为最稳定的二级结构。 蛋白质中的α-螺旋是右手螺旋。 氨基酸的所有侧链指向α-螺旋的外侧，以减少空间位阻效应，但α-螺旋的稳定性仍受R侧链大小、形状等的影响。 A.酸性氨基酸（特别是Glu）或 碱性氨基酸（Lys、Arg）集中的区域，(pH=7)由于同性电荷相斥，不利于?-螺旋的形成； B.较大氨基酸（Phe, Ile, Try）集中的区域, 由于空间位阻会影响其稳定性； C.脯氨酸和甘氨酸 是?-螺旋破坏者, 在?-螺旋中很少发现有这两个氨基酸的存在。 Ala易存在于α-螺旋中 2. β-折叠 β-折叠（β-pleated sheet或称β-sheet）是Pauling和Corey提出的另一种二级结构，也是蛋白质中最常见的一种主链构象，是指蛋白质分子中两条平行或反平行的主链中伸展的、周期性折叠的构象，很像α-螺旋适当伸展形成的锯齿状肽链结构 。 β-折叠分为：平行和反平行β-折叠。 氨基酸的R侧链交替出现在片层的上下。 反向平行 正向平行 β-折叠存在于β-角蛋白中，如羽毛、蚕丝和蜘蛛网等。 蚕的丝心蛋白（fibroin） 包含-Gly-Ser-Ala-Gly-Ala-的重复序列。 Gly氢原子位于β-折叠的一面；Ala的甲基、Ser的羟基位于另一面，形成紧密的堆积结构。 近年来的研究表明，某些情况下α-螺旋与β-折叠可发生结构间的转换，导致疾病发生。如疯牛病的病因可能与这种转换有直接的关系。 3