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研究生课程论文
课程名称 分子生物学
授课学期 2015 学 年 至 2016 学年
第 一 学期
学院 生命科学学院
专 业 野生动植物保护与利用
学号 2015011145
姓名 孙文斌
任课教师 秦新民
交稿日期 2016年3月 1日
成绩
阅读教师签名
日 期
广西师范大学研究生学院制
环状RNA与疾病研究进展
孙文斌
摘要:环状RNA(circular RNAs,circRNAs) 是一类广泛存在于各种生物细胞中具有调控基因表达功能的非编码RNAs,它是一类由特殊的选择性剪切产生且在真核细胞中广泛表达的环状内源性RNA分子,具有结构稳定、丰度高和组织表达特异性等特征。研究表明,一些circRNA作为竞争性内源RNA(ceRNA)来发挥基因表达调控的作用。circRNA利用其microRNA(miRNA)应答元件结合miRNA,以阻断miRNA对其靶标表达的抑制作用,从而调控其他相关RNA的表达水平。如CDR1as对miR-7的海绵作用与肺癌、乳腺癌、胶质瘤及肌萎缩性脊髓侧索硬化等疾病发生相关。cANRIL可通过影响多梳家族参与动脉粥样硬化的发生。大量circRNAs的发现及其结构和功能的阐明不仅可以使我们更加深入地了解疾病的发生机制,而且为相关疾病的预防、诊断和治疗提供了新的方向。本文主要从circRNAs的种类、结构与产生机制、功能与疾病的相关关系等几方面作总结性的综述。
关键词:环状RNA;MicroRNA海绵;反向拼接;抗疾病效应
1 circRNAs的种类
circRNAs最早在20世纪70年代在RNA病毒中被发现的。[1-2] circRNAs最初的表达量极低,被认为是剪接体介导的拼接错误产生的副产品[3]或逃逸内含子套索的中间产物[4]。因此科学家并没有去关注circRNAs,且认为circRNA在生理过程中并不起主要作用。直到2010年,随着生物信息学技术的快速发展,circRNA这一类古老且具有保守特征分子的神秘面纱逐渐被揭开。Salzman等[4]发现了数以百计的与人类基因表达相关的circRNAs。Jeck等[5]在人类成纤维细胞中检测到了高达25000种circRNAs。Memczak等[6]则从RNA测序数据中鉴定出1950种人类circRNAs,1903种小鼠circRNAs和729线虫circRNAs。Guo等[7]发现了与多种人类细胞系相关的36种生物样本中的7112种circRNAs。Li等[8]在人类Hela细胞中发现了111种circRNA。
目前发现的circRNAs根据其来源不同可以分为3大类,分别是:内含子来源的circRNA;外显子来源的circRNA;内含子-外显子来源的circRNA。
2 circRNA的结构与产生机制
生命体的遗传信息通过转录从DNA传递到RNA,再通过翻译传递到蛋白质。通常情况下,真核生物的基因在转录后通过前体mRNA剪接(pre-mRNA spelicing)去除基因内部的非编码内含子序列,然后将外显子链接在一起,形成成熟的mRNA分子,翻译成蛋白质。包括人在内的高等真核生物的可以通过可变剪接,由一个基因产生多种不同功能的成熟的RNA分子及相应的蛋白产物。在真核生物中存在一种反向的可变剪接,使得基因的外显子序列反向首尾相接形成环状RNA。
2.1外显子来源的circRNA
Jeck等[5]提出了外显子环化的两种模型:套索驱动环化(lariat-dirven circularization)和内含子驱动环化(intron-pairing-dirven circularization)。前者与外显子跳读有关,一个外显子的3ˊ剪接供体和另一个外显子的5ˊ剪接受体共价结合,即套索驱动的环化由外显子组成的剪接供体和剪接受体共价结合,接着切除内含子,然后形成circRNA(图A①);后者则先由两个内含子通过碱基互补配对形成环状结构,再切除内含子,最后形成circRNA(图A②)。
2.2内含子来源的circRNA
Zhang等[9]提出了内含子自身环化所形成的circRNA(circular intronic RNA,ciRNA)模型(图B)。
2.3外显子-内
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