五蛋白质组与蛋白质组学.ppt

蛋白质组与蛋白质组学 廖 之 君 第一节 蛋白质组学的概念 一、蛋白质组与蛋白质组学 基因组时代 →后基因组时代 研究重点的转移及其标志 功能基因组学的主要任务：解析和综合大量的遗传信息，阐明基因遗传信息与人类生命活动之间的联系。 2 3 后基因组时代 4 蛋白质 蛋白质是一种复杂的有机生物大分子，它们是生命活动的实际执行者。 蛋白质由氨基酸通过肽键首尾相连形成肽链，肽链再折叠形成一定空间结构。 5 蛋白质组(proteome) 蛋白质组是指“由一个基因组所表达的全部相应的蛋白质”。 同一基因组在不同细胞、不同组织中的表达情况各不相同; 在空间和时间上动态变化。 6 最早于1994年由澳大利亚一位博士后Wilkins提出,指的是“一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质。” 整体性 动态性 系统性 7 基因数量有限性和基因结构相对稳定性 vs 生命现象的复杂性和多变性 mRNA水平的基因表达研究取得进展,但mRNA与蛋白质间的r = 0.4～0.5 蛋白质自身特点难以从DNA和mRNA水平得到解答（如修饰、加工） 8 蛋白质组研究的理论基础 蛋白质组学(proteomics) 从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成、结构、表达水平与修饰状态，了解蛋白质之间的相互作用与联系，揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学。 9 同基因组学一样,蛋白质组学不是一个封闭的、概念化的、稳定的知识体系,而是一个领域。它旨在阐明生物体全部蛋白质的表达模式及功能模式。 内容包括蛋白质的定性鉴定、定量检测、细胞内定位、修饰状态、结构研究、相互作用研究等,最终揭示蛋白质功能。 是基因组ＤＮＡ序列与基因功能之间的桥梁。 10 蛋白质组学主要研究内容 了解某种特定的细胞、组织或器官制造的蛋白质种类； 明确各种蛋白质分子是如何形成类似于电路的网络； 描绘蛋白质的精确三维结构，揭示其结构上的关键部位，如与药物结合并且决定其活性的部位。 11 什么是功能蛋白质组学？(functional proteomics) 功能蛋白质组：细胞在一定阶段或与某一生理现象相关的所有蛋白质。 介于对个别蛋白质的传统蛋白质化学研究和以全部蛋白质为研究对象的蛋白质组学之间。 12 以细胞内与某个功能有关或某种条件下的一群蛋白质为主要研究内容。 从局部入手研究蛋白质组的各个功能亚群体。 将多个亚群体组合起来，逐步描绘出接近于生命细胞的“全部蛋白质”的蛋白质组图谱。 13 功能蛋白质组学 指对蛋白质-蛋白质、蛋白质-DNA/RNA 之间的相互作用研究。以细胞内与某个功能有关或某种条件下的一群蛋白质为主要研究内容， 由此建立细胞内外信号传递的复杂网络。 14 二、 蛋白质研究的简要史 15 1975年 双向凝胶电泳技术 1986年 第一个蛋白质序列数据库-SWISSPROT 1997年 出版了第一部蛋白质组学的专著 2000年3月 首次发表了一个生物体的完整蛋白质组（生殖器支原体） 2001年6月和2001年2月 公布了人类基因组框架图和序列图谱 2001年4月，国际人类蛋白质组组织(HUPO)正式成立 16 1. Human Liver Proteome Project(HLPP) 2. Human Brain Proteome Project(HBPP) 3. Proteomic Standards Initiative(PSI) 4. Human Antibody Initiative(HAI) 5. Plasma proteome Project(PPP) 6. Mouse Models Human Disease(MMHD) 7. Human Disease Glycomics/Proteome Initiative  (HGPI) 8. HUPO Cardiovascular Initiative(HUPO CVI) 9. Proteome Biology of Stem Cells Initiative HUPO:国际人类蛋白质组研究组织 17 人类蛋白质组计划 美国牵头的人类血浆蛋白质组计划 中国牵头的人类肝脏蛋白质组计划 德国牵头的人类脑蛋白质组计划 瑞士牵头的大规模抗体计划 英国牵头的蛋白质组标准计划 加拿大牵头的模式动物蛋白质组计划 日本牵头的糖蛋白质组计划 18 各国政府支持，国际著名研究和商业机构加盟 1996年澳大利亚建立了世界上第一个蛋白质组研究中心（Australia Proteome Analysis Facility，APAF） 19 美国国立癌症研究院（NCI）投资