1.5软件系统-激光共聚焦显微镜技术总结.pptx

1.5软件系统和计算机系统 激光共聚焦显微镜的结构特点—— 系统简介 01 图像采集 02 图像文件的保存和输出 03 系统的维护 04 Table of Contents 目录 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 1.2 软件界面简介 二、图像采集 开始操作： 打开软件后，默认在Acquire面板的acquisition中，acquisition mode为xyz，Format扫描像素为512x512，average line and frame average 为1。 根据需要选择扫描模式，常用的有以下几种：xyz 层面扫描；xyt 时间扫描；xyλ光谱扫描。 扫描像素 一般选1024×1024 设置平均 一般选择line average 2-3次 Leica TCS SP8激光共聚焦显微镜系统软件操作 注意：一般在扫描结束后统一保存，为免数据丢失，可以从获取第一张图片后就要开始保存，以后每获取一张图片保存一次。 1、保存Leica .lif 文件 进入Acquire 面板的Experiment 中，右键点击Experiment，从弹出菜单中选中“Save Experiment “Experiment” as…”，保存lif文件到自己的文件夹中并取名。 2、导出lif文件 右键点击Experiment，从弹出菜单中选中“Export Experiment as tiff”，选择目标文件夹，选中rawdata导出单通道图片。 如需导出overlay 图片，则再次右键点击Experiment，从弹出菜单中选中“Export Experiment as tiff”，选择目标文件夹，选中overlay 导出多通道合成图片。 1、获取单一荧光图像 2、获取多荧光图像 1、点击seq ，出现sequential scan面板。 2、在sequential scan面板中点击scan 1，在beam path setting 中选择所标记的一种荧光的光路设置方法。 点击live开始连续扫描，优化图像质量。 调节z position选择需扫描层面，调节gain和offset 使图像亮度和背景到达到合适的状态，Zoom调节电子放大倍率。 点击stop，停止扫描。 在sequential scan面板中点击“+”，点击scan 2，在beam path setting 中选择所标记的另一种荧光的光路设置方法，点击live开始连续扫描，优化图像质量。 标记了几种荧光就添加几种方法。 选择“between frames ”模式。 3、选择像素1024×1024，点击Start获取图像。 4、保存图像。 3、获取多层荧光图像 1、在beam path setting 中选择所标记荧光的光路设置方法。 2、打开Z-stack 面板。 3、点击live开始连续扫描，优化图像质量。 调节z position选择需扫描层面，设置begin和end ，调节gain和offset 使图像亮度和背景到达到合适的状态，Zoom调节电子放大倍率。 点击stop，停止扫描。 在Z-stack 面板中确定Nr. Of steps （在选择层面中确定需扫描张数） 4、点击start获取图像。 5、如需将扫描图像叠加，选择Process 面板，选择visualization 3D projection ，点击apply ，即可生成叠加图像。 6、 保存图像。 4、获取时间序列图像 1、Acquisition mode 改为xyt。 2、根据需要拍摄图像的时间间隔和图像质量调整fomat 和line average值。 3、在beam path setting 中的load/save single setting 中选择所标记荧光的光路设置方法。 如是多种荧光则选择点击seq，设置序列扫描。 4、点击live开始连续扫描，优化图像质量。 调节z position选择需扫描层面，调节gain和offset 使图像亮度和背景到达到合适的状态，Zoom调节电子放大倍率。 点击stop，停止扫描。 5、点击start获取图像。 6、保存图像。 三、图像文件的保存和输出 三、图像文件的保存和输出 三、图像文件的保存和输出 三、图像文件的保存和输出 三、图像文件的保存和输出 四、系统的维护 THANKS NAME