基因组学第7章蛋白质组的合成与加工详解.pptVIP

氨酰tRNA合成酶将氨基酸连接到tRNA上 密码子-反密码子相互作用：tRNA与mRNA相连接 特异性 密码子与反密码子配对 摆动性 密码子第三个核苷酸与反密码子第一个核苷酸配对不严格 1)G-U配对 2)反密码子中第1位的次黄嘌呤(I)可与A、C、U配对 细菌中摆动性的两个例子 解码人类基因组时摆动性预测表 第二节 核糖体在蛋白质合成中的作用 核糖体结构 翻译起始 翻译的延伸阶段 翻译的终止 古生菌中的翻译 核糖体结构 核糖体是把氨基酸组装成蛋白质的工厂 rRNA是核糖体的主要成分之一 核糖体可以解离成大小两个亚基 大肠杆菌16S rRNA的碱基配对结构 细菌核糖体 细菌的翻译起始需要内部核糖体结合位点 细菌SD序列：细菌mRNA中核糖体结合位点，与核糖体16SrRNA结合位于起始密码子上游3-10核苷酸之间 大肠杆菌的翻译起始 真核生物翻译起始 由帽子结构和poly（A）尾介导 前起始复合体组装 帽子结合复合体 扫描 Kozak序列 polyA结合蛋白（PAB) 翻译起始的调节 核糖体蛋白合成的自我调节 铁蛋白合成的调节 整体调节 转录物特异性调节 翻译的延伸阶段 大亚基的结合将产生两个可结合氨酰tRNA的位点： P位点（肽位点） A位点（氨酰位点） 核糖体的重要位点 大肠杆菌中三种罕见的翻译延伸事件 程序性移码 翻译滑移 翻译跳跃 翻译的终止 释放因子 到达终止密码子时，释放因子模拟tRNA的结构进入A位点 真核释放因子eRF-1 与tRNA结构相似 Nature：poly(A) 尾巴长度与翻译效率 Nature, 29 January 2014; doi:10.1038/nature13007 第三节 蛋白质翻译后加工 蛋白质折叠 蛋白质水解切割的加工 化学修饰加工 内含肽 蛋白质折叠：正确的三级结构 蛋白质的变性(去折叠、不正确折叠)与复性(正确折叠) 某些小分子蛋白当去除变性剂时具有自动折叠的能力 活性 黏度 错误折叠的蛋白质可能重新折叠成正确的构象 细胞内的分子伴侣辅助蛋白质正确折叠 Hsp70类分子伴侣 伴素类分子伴侣 Genomes 合成、降解、和修饰/加工共同作用使蛋白质组可以满足细胞变化需求，并对外界刺激做出反应。 本章我们将学习上述内容。 蛋白质合成： 三种RNA 1) mRNA：密码子，指导蛋白质合成 2) tRNA：反密码子，识别并转运氨基酸 3) rRNA：核糖体的主要成分 三个过程 1) 翻译的起始 2) 肽链的延伸 3) 翻译的终止 * tRNA在翻译中起关键作用。 tRNA，即转运RNA（Transfer RNA），是用来运送氨基酸到对应的mRNA密码子上的小RNA。 1956年，Crick预言了它们的存在，作为接头分子，它们连接mRNA和合成中的多肽。这既是一种物理连接，也是一种信息连接。为理解tRNA如何发挥这种双重作用，我们必须先研究氨酰化。 * tRNA只有74-90多个核苷酸，很小且可以纯化出单一种类的tRNA，所以它们是最早被测序的核苷酸之一，1965年就进行了测序。 tRNA有74-95个氨基酸组成，形成带有4个恒定臂的三叶草二级结构（在更长的tRNA中另有一个侧臂）。其中包括： 接受臂：由碱基配对的干组成，其端部有不配对的序列，其2或3’羟基能与氨基酸相连； TΨC臂：因其含有TΨC三联体而得名（Ψ代表假尿嘧啶，一种修饰碱基） D臂：因其含有二轻尿嘧啶而得名 额外臂：位于TΨC臂与反密码子臂之间，由3-21个碱基组成 反密码子臂：在其环中央含有反密码子三联体 tRNA的特异性只取决于反密码子，也就是说，例如即使使用还原脱硫将半胱氨酸-tRNA改变为丙氨酰-tRNA，他的反密码子对应于UGU，单纯的氨基酸改变并没有影响到密码子与反密码子的相互作用。也就是说，一旦tRNA结合上了氨基酸，氨基酸将不再影响tRNA的特异性。 每个tRNA的二级结构进一步折叠成紧凑的L形三级结构，其中与氨基酸结合的3端远离与密码子结合的反密码子。 tRNA的结构为其功能提供了一个普遍结论：其执行特定功能的位点最大限度的分开。 ? * tRNA的氨酰化是由氨酰tRNA合成酶催化的。 在翻译过程中，每种tRNA分子都需要与相应的氨基酸结合，然后将这些氨基酸运送到核糖体进行蛋白质合成。这种结合是在一系列氨酰tRNA合成酶的作用下完成的，这些酶通过酯化反应将正确的氨基酸与对应的tRNA分子相连接。连接反应的第一步是在合成酶作用下，ATP分子和对应的氨基酸（或其前体）结合形成氨酰-AMP（腺苷酸），并释放出无机焦磷酸（PPi）。然后，酶与氨酰-AMP复合物再与正确的tRNA分子结合，催化氨基酸从氨酰-AMP转移到tRNA