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- 2016-08-22 发布于贵州
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蛋白质组学研究的高通量解决办法
蛋白质组学研究的高通量解决办法
高密度DNA和蛋白质芯片是小的平面,它允许在一次实验中同步分析几千个分子指标。DNA芯片导致了更小的样本体积、更有效的分析和更高的输出。因为蛋白质与核酸相比更加复杂和多样,发展类似的蛋白质组学平台已经表明是困难的。此综述概括近期用于高密度蛋白质芯片制作和应用的技术,重点介绍它在蛋白质组学近期的进展和应用。
微阵列的生产是一个高度自动化的过程,它使用点样针(pin)为基础或液体微分配的操纵自动仪器在一个平面上排列生物样本。对于DNA芯片的制作,PCR技术已经成熟建立并在大规模基因组分析中起中心作用。阵列所用的表面随着应用的不同而变化,比如,如果需要分析大量样品与相同配体之间的相互作用,DNA排列到滤膜(比如硝酸纤维素膜、尼龙膜、聚偏二氟乙烯)上或者包被有不同试剂(比如多聚-L-赖氨酸或者聚丙烯酰胺)的玻片上。
芯片的制作
相似的技术已经被用来制作高密度蛋白质芯片和微阵列(Fig.1)。此方法牵涉到使用格栅自动仪器从微滴度平皿转移DNA或者相应表达的蛋白质到尼龙膜(Hybond N+, Amersham, DNA分析用)或者聚偏二氟乙烯膜上(Hybond-PVDF, Amersham, 蛋白质分析用)上的高密度格栅中。点样自动仪器在一个servo控制的3轴线性驱动系统上携带384个点样头,定位可以准确到5μm,产生的密度大约为300点/cm
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