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第一章蛋白质的结构与功能(StructureandfunctionofProteins)本章要点蛋白质分子组成特点：C、H、O、N，N占16％基本组成单位氨基酸L-α-氨基酸分类:四大类理化性质肽与肽键及氨基酸残基、N－末端、C－末端的概念蛋白质结构一级结构：定义、化学键二级结构：定义、化学键、种类、肽单元及motif概念四级结构及亚基：定义、化学键三级结构：定义、化学键、结构域蛋白质的理化性质：两性电离、胶体、变性及沉淀、紫外吸收、呈色反应分离纯化及结构分析：透析、沉淀、电泳、层析、超离等蛋白质结构与功能的关系第一节蛋白质的分子组成单纯蛋白质：分子中仅含aa蛋白质分类结合蛋白质蛋白质部分无机离子有机化合物辅基按组成按形状：球状和纤维状按功能：酶、载体、运动、结构、支架、免疫等一、蛋白质元素组成：C、H、O、N、S等，N占16％蛋白含量测定（凯氏定氮法）：每克样品中所含蛋白质的克数=每克样品中的含氮量（克）×6.25(Aminoacid)L-α–氨基酸（甘氨酸除外）（一）氨基酸的结构和分类二、氨基酸结构通式H3NCCOOHHRHOCCHOHCH2OHL-α–氨基酸L-甘油醛非极性疏水氨基酸极性中性氨基酸极性疏水氨基酸甲硫氨酸Met，M酸性氨基酸碱性氨基酸羟脯氨酸和羟赖氨酸+NH3+NH3（二）氨基酸的理化性质两性解离与等电点(isoelectricpoint，pI)以丙氨酸为例（参见P29表2-1）:三种芳香族氨基酸的紫外吸收光谱Trp与Tyr在280nm波长处有吸收峰，可用于蛋白定量分析2、氨基酸的紫外吸收3、与茚三酮的呈色反应：蓝紫色，可用于aa定性及定量分析第二节蛋白质的分子结构一、蛋白质的一级结构（10-50aa）A：多肽链的结构式；B：中文表示法；C：英文三字母表示法；D：英文一字母表示法。书写多肽链时，从氨基末端写起，并写在左面。ABCD多肽链的表示法：（二）蛋白质的一级结构（primarystructure）是指蛋白质分子中多肽链的氨基酸排列顺序和二硫键的位置。维系一级结构的化学键主要是肽键，有些含有二硫键。（三）蛋白质的一级结构1、蛋白质一级结构的概念二、蛋白质的空间结构：二、三、四级（一）蛋白质的二级结构蛋白质的二级结构(secondarystructure)是指蛋白质分子中某一段多肽链主链原子的空间分布状态，不涉及侧链的空间排布。构成蛋白质主链空间构象的基本单位是肽单元（peptideunit)或称肽键平面。1.肽单元肽平面（α－helix）2.蛋白质二级结构的主要构象1)α-螺旋（α－helix）结构特点：以肽单元为单位，以Cα为旋转点，形成右手螺旋每经过3.6个氨基酸，螺旋上升一周，螺距0.54nm第一个肽键的-CO-与第四个肽键的－NH－形成氢键，维持螺旋的稳定性，氢键的方向与中心轴方向基本平行。氨基酸侧链伸向外侧氨基酸侧链影响α-螺旋的形成:(β－pleatedsheet)2)β－折叠（βpleatedsheet）顺平行结构特点：多肽链充分伸展，肽单元以Cα为旋转点依次折叠成锯齿状结构（或折纸状）氨基酸侧链交替位于锯齿状结构的上下方常常2个以上的β-折叠平行排列，相互之间走向可以相同，亦可以相反，平行的肽段之间形成氢键Growthhormonereceptor：(β－turnrandomcoil)3)β－转角和无规卷曲结构特点：β-转角常出现在肽链呈180°回折处多由4个氨基酸残基组成，第1个氨基酸的CO－与第4个NH－形成氢键。转角的第2个氨基酸多为脯氨酸，有时可为Gly。3.模体（motif)－超二级结构指蛋白质分子中具有二级结构的肽段相互靠近，形成具有特定功能的空间构象，或者单个具有特定功能的短小肽段，称为模体。类型：螺旋束、折叠-螺旋-折叠、锌指、亮氨酸拉链、发夹环、螺旋-转角-螺旋等-螺旋-转角HTH模体结构示意图螺旋-转角-螺旋模体由2个螺旋和1个转角组成，是DNA结合蛋白三维结构中的一部分螺旋螺旋转角NC（二）蛋白质的三级结构蛋白质的三级结构是多肽链中所有原子（包括主链和侧链）在三维空间的排布位置与它们的相互关系。稳定三级结构的主要化学键是非共价键（次级键），有些包括二硫键。次级键：氢键、离子键（盐键）、疏水作用、VanderWaals力（原子间的相互引力）蛋白质的结构域某些多肽链在形成三级结构时，可形成一个或数个球状或纤维状的区域，每个区域都折叠紧密，各自行使其特定的功能，这些区域称为结构域（domain）。细胞癌基因src的表达产物Src结构展开图此蛋白是典型的非受体型酪氨酸蛋白激酶，含三个结构域：SH2、SH3和蛋白激酶。其C端含一个可被磷酸化的酪氨酸残基。SH2和SH3可分别识别蛋白质的相关结构，并与之相结合。蛋白激酶结构域具有蛋白激酶活性（见第十九章　细胞信号