第三章核酸序列的一般分解.ppt

第三章 核酸序列的一般分析 第一节 核酸序列的检索 第二节 核酸序列的基本分析 第一节 核酸序列的检索 核酸序列检索是核酸序列分析最为基本的一个方面。 通过NCBI使用Entrez系统进行检索。 通过EBI的SRS服务器来检索。 第二节 核酸序列的基本分析 分子量、碱基组成、碱基分布 核酸序列的分子质量、碱基组成、碱基分布等分析可通过一些常用软件如BioEdit、DNAMAN等直接获得。 序列变换 进行序列分析时，经常需要对DNA序列进行各种变换，例如反向序列、互补序列、互补反向序列、显示DNA双链、转换为RNA序列等。这些使用DNAMAN软件可以很容易实现这些功能集中在“显示序列”，从中可选择不同的序列变换方式对当前的序列进行转换。 限制性酶切分析 DNAMAN、BioEdit、DNAStar 克隆测序分析 测序峰图的查看：Chromas.exe BioEdit DNAMAN 载体序列的去除：/VecScreen/VecScreen.html ORF分析 基因编码区是指可以由核糖体翻译成蛋白质的序列，它的5’端有转录和翻译的起始位点，3’端有终止位点。基因的起始位点通常是ATG，终止位点为TAA、TAG、TGA。一个起始和终止密码子之间的序列称为一个开放阅读框（Open Reading Frame，简称ORF），它是一个潜在的蛋白质编码区。