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结肠癌组织IL―10和IFN―γ mRNA的表达及其临床意义.doc
结肠癌组织IL―10和IFN―γ mRNA的表达及其临床意义
【摘要】 目的:研究结肠癌组织白细胞介素-10(IL-10)和干扰素-γ(IFN-γ)的基因表达及其相关的启动子区甲基化状态。方法:随机选取2011年1月-2014年6月80例结肠癌患者组织为结肠癌组、80例相应癌旁组织为癌旁组和100例正常健康者结肠组织为对照组。采用亚硫酸氢盐测序法、甲基化特异性PCR和实时荧光定量PCR检测对IL-10和IFN-γ基因的甲基化状况进行检测,分析其与结肠癌主要临床特征之间的关系。结果:三组组织的IL-10和IFN-γ mRNA 水平之间比较,差异均有统计学意义(P癌旁组对照组,差异均有统计学意义(P0.05)。结论:IL-10和IFN-γ基因启动子区甲基化状态影响其在结肠癌组织中的表达,结肠癌患者处于TH2极化状态,与结肠癌发生发展密切相关。
【关键词】 结肠肿瘤; DNA甲基化; 组织; 干扰素-γ; 白细胞介素-10
结肠癌患者机体内免疫微环境的变化已经受到人们的重视,其中辅助性T细胞(Th)亚群Th1/Th2的失衡在恶性肿瘤免疫逃逸与免疫耐受中非常重要[1]。在哺乳动物细胞基因组中,约有3%~5%的胞嘧啶被甲基化,基因甲基化异常与结肠癌变化密切相关[2],因此制定结肠癌Th1、Th2相关细胞因子DNA甲基化谱对结肠癌的早期诊断有重要意义。本文通过检测结肠癌患者结肠组织中Th1/Th2型细胞因子白细胞介素-10(IL-10)和干扰素-γ(IFN-γ)基因启动子区甲基化状态及转录活性,旨在探讨DNA甲基化与基因表达的关系及其在结肠癌中的作用,为结肠癌的诊断和治疗提供新的靶点。
1 资料与方法
1.1 一般资料 随机选取2011年1月-2014年6月本院住院部就诊的80例结肠癌患者组织为结肠癌组、80例相应癌旁组织为癌旁组和100例正常结肠组织为对照组。结肠癌患者年龄34~75岁,中位年龄49岁,男55例,女25例,病理类型均为鳞癌,根据WHO标准分级[3],高分化鳞癌14例,中分化鳞癌42例,低分化鳞癌24例。对照组32~75岁,中位年龄49岁。收集三组患者的结肠组织标本,其中对照组标本来源于结肠息肉组织,结肠癌组标本来源于结肠活检和手术治疗,癌旁组标本来源于结肠癌旁组织手术,结肠癌患者所有手术标本均经过本院病理学专家明确诊断,在患者手术中取病理标本,标本放入液氮中速冻后-80 ℃条件下保存待检,样本获得了伦理委员会批准并签署知情同意书。
1.2 方法
1.2.1 目标标本相关的DNA和RNA提取 均按试剂盒说明书提供的方法提取三组结肠组织DNA与RNA,并采用琼脂糖凝胶电泳并鉴定DNA和RNA完整性。
1.2.2 IL-10和IFN-γ基因启动子区甲基化检测 按照EZ DNA Methylation-GoldTM Kit试剂盒(购自美国Zymoresearch公司)操作说明对DNA进行甲基化修饰及纯化。在NCBI线上检索IFN-γ(J00219)和IL-10(AF418271)基因启动子区序列,Methyl Primer Express V2.0软件进行分析核对参考物[4],亚硫酸氢盐测序法(BSP)检测IL-10基因启动子。基化特异性PCR(MSP)检测IFN-γ基因启动子区非甲基化及甲基化基因,IL-10和IFN-γ基因启动子区序列一甲基化特异性PCR和RT-PCR 引物序列如表1所示。基化结果判断:出现甲基化特异性引物扩增产物判断定为甲基化,仅非甲基化特异性引物扩增产物判断定为非甲基化。
1.3 统计学处理 数据采用SPSS 17.0软件进行统计学分析,计量资料以 (x±s)表示,采用t检验,计数资料采用 字2检验,P0.05为差异有统计学意义。
2 结果
2.1 三组结肠组织IL-10和IFN-γ mRNA的表达比较 三组IL-10和IFN-γ mRNA 水平比较,差异均有统计学意义(P0.05),其中结肠癌组和癌旁组IL-10 mRNA均高于对照组(P0.05),IFN-γ mRNA均低于对照组(P0.05),结果见表2。
2.2 三组IL-10和IFN-γ基因启动子区甲基化率比较 三组结肠组织IL-10基因启动子区-320、-350、
-352、-373位点甲基化率进行相互比较,差异均无统计学意义(P0.05);三组结肠组织基因启动子区-110、-185位点甲基化率进行相互比较,差异均有统计学意义(P癌旁组对照组,差异均有统计学意义(P0.05),结果见表3;三组结肠组织提取DNA的IFN-γ基因启动子区甲基化状态见电泳图1。
2.3 IL-10基因启动子区 通过在线的TFSEARCH软件分析发现,IL-10基因启动子区包含
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