上师大研究生生物信息学试题.docVIP

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2017-06-08 发布于重庆
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上师大研究生生物信息学试题.doc

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上师大研究生生物信息学试题

上海师范大学生物信息学2015～20学年第学期 2015年12月专业年级姓名学号 1, 有四条序列如下（8分）： 1 TCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGTA 2 CGTATACGTTAGTTCATCGTAATGAG 3 GGGTAGAGTAGCGTATCATGCCCGTATAC 4） AATGCACGGGGTAGGACTAATTGGA 使用软件Clustal对这些序列进行全序列分析和分子进化分析，并用软件TreeView 画进化树，将得到的Alignment和进化树呈现在答卷上。 2, 请举例说明两条序列分别在ungapped和gapped的情况下形成alignment的差异，并比较它们的同源性（10分）。 3, 用软件RNA structure预测序列（cguaauccauguacaaaauauaguu uaguguauau）的二级结构，并将其二级结构画到答卷中（8分）。 4, 有一条序列如下： 5’-ACTAAGTTGCAT-3’ 请以这条序列为例，简述双脱氧法测序的原理（要求有图和文字描述）（8分）。 5, 下载与你的研究方向相关的RNA序列5条，完成下列分析（总分30）： ① 描述你的研究方向（6分）。 ② 请在最小宽度为20，最大宽度为24的条件下，写出它们的BLOCK序列，位置以及重要程度（12分）。 ③ 预测这5条BLOCK序列的二级结构，并进行比较（12分）。 6, 结合你的专业或研究方向的特点，设计一个科学问题，试用你目前学习的生物信息学方法予以解决。请将设计的科学问题以及技术路线和解决的结果简要地呈现在答卷中（总分36分）。要求： ① 你设计的科学问题是什么? （8分） ② 解决这个科学问题的技术路线是什么? （14分） ③ 得到的结果是什么? （14分）请将答卷打印在A4纸上，和试题一起交上来 1