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Chapter 4 Chemistry of Protein第四章蛋白质化学.ppt
Chapter 4 Chemistry of Protein 第四章 蛋白质化学 主 要 内 容 Protein的分子组成 Protein的分子结构 Protein结构与功能的关系 Protein的理化性质 什么是蛋白质 protein ？ 第一节 Protein的化学组成 一、Protein的元素element组成 元素element构成： 碳——50%-55% 氢——6%-7% 氧——13%-19% Nitrogen N ——13%-19% 硫——0%-4% 其他—— The relation between N content and total protein： mgPr mgN×6.25 二、氨基酸amino acids AA 的化学结构 ⒉ AA的碳原子编号——α-AA 三、Classes of AA ★ 非极性疏水R-AA ★ 极性不带电荷R-AA ★ 带正电荷R-AA Basic AA ★ 带负电荷R-AA Acidic AA ★ Essential AA and non-essential AA ★ Non-standard AA 羟脯氨酸 羟赖氨酸 N-甲基赖氨酸 硒代半胱氨酸 胱氨酸 γ-羧基谷氨酸 鸟氨酸、瓜氨酸 四、Classes of Protein By components: simple protein: albumin, globin conjugated protein: lipoprotein, glycoprotein, ribonucleoprotein By source: animal/vegetable/microorganism protein By configuration: fibrous protein, globular protein 第二节 Chemical structure of protein 一级结构primary structure 二级结构secondary structure 三级结构tertiary structure 四级结构quaternary structure 基本概念： 游离氨基酸free AA, FAA 氨基酸残基AA residue 肽键peptide bond：刚性作用 肽平面/单元peptide plane/unit 寡肽oligopeptide 多肽/链polypeptide/chain N-端N-terminal/C-端C-terminal 谷胱甘肽Glutathione，GSH Two peptides N-terminal and C-terminal Chemical bonds holding protein configuration: peptide bond disulfide bond 氢键hydrogen bond 疏水作用hydrophobic interaction 离子键ionic bond 范德华力Van der Waals interaction 一、 Primary structure Definition： The linear sequence of amino acids is the primary structure of a protein including disulfide bridge . 生物学意义： 基础、病理、进化 Bovine insulin是第一个阐明P. S.的protein，也是第一个人工合成的protein 。它含A、B两条peptide chains，A链有21个AA residues，B链有30个AA residues，此外含6个Cys，构成3个disulfide bridges，其中2个在A、B链之间，A链内还有1个disulfide bridge。 二、 Secondary structure Definition：Secondary structure is a local regular occuring structure in proteins and is mainly formed through hydrogen bonds between backbone atoms. So-called random coils无规则卷曲, loops环状结构 or turns转角 dont have a stable secondary structure. There are two types of stable secondary structures: Alpha helix α-螺旋 and beta-sheet β-折叠 . Alpha-helix and beta-sheet are pr
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