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团图点删除问题的近似算法.doc
团图点删除问题的近似算法
摘要:针对团图点删除问题的3近似算法得到的近似解可能较大的问题,通过对团图点删除问题及团图特性的分析,提出了该问题的一个新的近似算法。新算法通过考察图中节点的一阶和二阶邻点来计算节点关联的P3的数目,然后优先选择P3数最大的节点加入解集,以期尽快消除图中的P3,从而最终获得较小的点删除集。为检验算法效果,设计了多组不同场景的随机实验对新算法和经典的3近似算法进行了比较。随机实验表明,新算法较经典的3近似算法有明显的优势。
关键词:团图点删除;团;NP完全;近似算法;团图分析
中图分类号: TP301.6
文献标志码:A
Approximation algorithm of cluster vertex deletion
GAO Wenyu*, LI Hua
School of Information Science, Guangdong University of Finance and Economics, Guangzhou Guangdong 510320, China
Abstract: Since the solution set obtained by 3approximation algorithm of cluster vertex deletion problem is probably big, a new approximation algorithm was proposed through analyzing the characteristics of cluster. In the new algorithm, the number of P3 related to each vertex in the graph was counted by examining firstorder neighbors and secondorder neighbors of each vertex, and then the vertex with maximum number of P3 was selected into the solution set to eliminate P3 as soon as possible, which led to a smaller vertex deletion set. In order to verify the performance of this new algorithm, several sets of randomized simulation were designed. The simulation results show that the new algorithm outperforms the classic 3approximation algorithm.
英文关键词Key words:
cluster vertex deletion; clique; NPcomplete; approximation algorithm; cluster analysis
0引言
图的修改问题(graph modification)[1-3]是图论中一类重要的问题,其中团图修改问题(cluster modification)[4-6]也是近来算法研究的热点问题。团图点删除问题(Cluster Vertex Deletion,CVD)[7-8]就是其中之一,简单地说,团图点删除问题就是在给定的图中,通过删除一些节点来使得剩余图是一个团图。
团图点删除问题在大数据处理中有着重要的意义。例如在数据聚类中,来自现实世界的数据样本(如生物DNA数据)可以使用图来建模,每一个节点代表一个数据样本,节点之间若有边相连则代表数据样本是同类的。若数据都是理想化无误差的,那么这些数据样本构成的图就是一个团图,同类的数据在团图中属于同一个团。然而来自现实世界的数据可能受到污染或由于取样带来的误差而导致由数据样本建立的图不是团图,因此就需要对图进行尽量少的修改而得到代表数据聚类结果的团图。
团图的特性是可继承的,因为团图的任意诱导子图仍是团图。而且对于团图的判定存在一个简洁的充要条件,即一个图是团图当且仅当该图中不存在长度为3的诱导简单路径(P3)。由此,结合Lewis[2]关于继承图上的点删除问题的结论可知,团图点删除问题是NP完全问题。同时,根据这个充要条件也可以得到一个简洁的3近似算法。因为只要反复从图中找出P3并删除,直至图中不再有P3,这样就会得到一个团图,而最终所删除的节点数不会超过最优删除节点数的三倍。
另外,团图点删除问题也可以视为
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