种畜的遗传评估（二）.ppt

种畜的遗传评估（二） 选择指数 选择指数是Smith（1937）在植物育种中首先提出来，随后Hazel和Lush（1942），特别是Hazel（1943）对这一方法作了系统的论述，并给出了具体的计算方法。 由于选择指数法具有较大的优越性，在过去的30余年中得到了很大的发展，从一般的综合选择指数发展为约束选择指数、最宜选择指数、以及通用选择指数等，因而成为多性状选择的一种重要的方法。 一、选择指数概述 选择指数的类别 经典选择指数（selection index） 由Hazel（1943）提出。它将需要选择的几个性状 ，依据各自的遗传力、表型方差、经济加权值，以及相应的遗传相关和表型相关，制定的一个综合指标。然后计算出各个体的指数值，依据指数值的高低进行选留和淘汰。 约束选择指数（restricted selection index） 由Kempthorne（1959）等提出，是在普通选择指数的基础上，通过对性状的改进施加某种约束条件，使一些性状改进的同时，保持另一些性状不发生改变。 最宜选择指数（optimum selection index） 由Tallis(1962)提出，是在普通选择指数的基础上，通过对性状的改进施加某种限制，使一些性状按适当的比例要求改进。 通用选择指数（general selection index） 由陈瑶生和盛志廉(1988，1989)提出，是在普通选择指数的基础上，能充分利用各种可能获得的信息，即包括个体本身及各种亲属的各个性状的任意信息，适用于各种选择指数的统一的通用选择指数。 选择指数与育种值 综合育种值： 选择指数： 综合育种值与选择指数的线性预测关系： 二、普通综合选择指数 经典选择指数 指数式的一般形式 为性状的加权系数，也即为偏回归系数 经典的综合选择指数是依据个体本身的多个性状的表型值来估计个体综合育种值，目的是要获得一个指数 ，用它可以达到最准确地估计 ，即令综合育种值与指数间相关 最大化，从而获得最大的综合育种值进展 ，利用求极大值方法可以得到多元正规方程： 是各选择性状的偏回归系数向量 是各选择性状表型值之间的方差、协方差矩阵 是各选择性状育种值之间的方差、协方差矩阵 是各选择性状的经济加权值向量 选择指数效果的度量 综合育种值估计准确度 综合育种值选择进展 各性状育种值选择进展 举例 选择计划制定一般步骤 性状各种表型参数和遗传参数的估计； 性状经济加权值的确定； 选择强度估计； 选择指数制定和选择效果估计； 计算个体指数值，确定选择决策。 选择指数制定步骤 计算性状的表型方差、协方差矩阵和育种值方差、协方差矩阵； 计算各性状偏回归系数 选择效果估计 计算个体指数值 例1 通用选择指数 通用选择指数的构建 通用选择指数效果度量 综合育种值估计准确度 综合育种值选择进展 各性状育种值选择进展 信息性状表型值方差协方差的计算 一个个体单次度量值 和 一个个体 次度量值均值 和 个个体单次度量均值 和 第三类：两个不同信息来源，一个性状间的协方差或一个性状与另一个性状间的协方差 例2 三、约束与最宜选择指数 约束选择原理 约束选择指数效果度量 综合育种值估计准确度 综合育种值选择进展 各性状育种值选择进展 例3 表示目标性状间的育种值方差、协方差矩阵 * 某猪场的资料分析得到三个性状：饲料利用率、平均日增重和胴体瘦肉率的表型、遗传参数，以及性状的边际效益，列入下表，根据给定的参数制定这三个性状的选择指数，并计算如下两头猪的指数值： A： B： 表7-1 猪三个性状的表型遗传参数和边际效益 （表中右边4项的右上角为表型相关；右边4项左下角为遗传相关） — -0.10 -0.39 4.71 0.46 10.40 60 % 胴体瘦肉率 -0.25 — -0.75 4257.6 0.35 0.11 650.0 g 平均日增重 -0.23 -0.65 — 0.12 0.30 -78.80 2.8 kg/kg 饲料利用率 单位 性状 由表中参数计算三个性状的表型方差、协方差矩阵为： 其中： 其它元素可类似计算得到。而三个性状的育种值方差、协方差矩阵为： 其中： 其它元素可类似计算。而边际效益，即经济加权值为： 由前面的回归公式得到： 所以这三个性状的综合选择指数为：