化学生物学手抄版讲解.doc

生命体系中的有机小分子：初级代谢产物：生物通过代谢活动所产生的、为自身生长和反制所必需的物质次级代谢产物：微生物生长到一定阶段才能产生的化学结构十分复杂的、对该生物无明显生理功能的或并非是微生物生长和反制所必需的物质一．分类 脂类化合物：由脂肪酸和醇作用生成的酯及其衍生物统称为脂类，一般不溶于水，而溶于脂溶性溶剂，包括脂肪、三酰甘油、磷脂、糖脂等。分类：（1）储存脂质【储存能量】（三酰甘油，蜡）：能量的主要储存形式，相比于其它能源分子具有优势：1.1g油脂产生的能量比糖和蛋白质多2.甘油三酯是疏水分子，因此机体不必像储存多糖那样携带结合水。（2）结构脂质【细胞膜组成成分】水介质中，膜脂的亲水头部和非亲水尾部装配成表面亲水、内部疏水的磷脂双分子层，使膜内外亲水性物质不能自由交换。（3）活性脂质【信号分子】：具有重要功能的生物类脂质：电子载体（线：泛醌 叶：质体醌）、酶的激活剂或辅助因子、糖基载体、细胞内信号 生物碱：一类含氮原子的碱性有机小分子（不包括aa和多肽)是大多数要用植物的有效成分 分类：（1）喹啉类：以喹啉环为基本母核（奎宁【疟疾】和喜树碱【抗癌】）（2）异喹啉类：（吗啡【麻痹神经，成瘾】，普罗托品（3）吡咯烷类（茛菪碱、党参碱）（4）吲哚类（利舍平【镇静，降血压】、长春新碱【白血病、抗癌】）甾体：植物甾醇、性激素、肾上腺皮质激素、胆汁酸、昆虫变态激素、强心苷、甾体皂苷、蟾毒配基，结构中都具有环戊烷骈多氢菲的甾体母核分类：（1）甾体激素：肾上腺皮质分泌的肾上腺皮质激素；雄性激素和雌性激素；（2）甾醇：饱和或不饱和的仲醇（胆固醇）（3）甾体皂苷：防治心血管疾病、抗癌 萜类：异戊二烯低聚物以及他们的氢化物和含氧衍生物的总称。大多是从植物提取得到的香精油的主要成分，多数不溶于水，易挥发，具有香味的油状物质。分类(异戊二烯骨架数)：（1）单萜：二个+衍生物（2）倍半萜：三（3）二萜：四 （4）其他萜类化合物 醌类：分子内具有不饱和环己二酮结构（醌式结构）的天然有机化合物，中药大黄、首乌、虎杖的有效成分。聚酮类：一大类由细菌、真菌和植物通过低级羧酸的连续缩合反应的天然产物非核糖体合成多肽：从多种生物体内分离出的含有N-甲基化骨架和非天然氨基酸的天然多肽类化合物。这些结构的改变有利于增强它们对蛋白酶的水解的稳定性、对膜的通透能力以及与靶标的亲和性等。它们通常不由核糖体合成，不需要mRNA模板，而是由复杂的非核糖体多肽合成酶合成而来。（万古霉素）二、来源：1、生物：生物合成（生物体内同化反应总称）；酶参与催化，相对于化学合成途径具有反应条件温和、立体专一性强和速度快的特点（乙酰辅酶A、莽草酸、甲羟戊酸酯）2、化学：全合成：人为利用用简单的有机小分子原料来构建复杂分子的化学过程。全合成的意义：确定复杂天然产物精确化学结构，天然产物修饰以及衍生化的基础，为设计出比天然产物更具优良活性的药物分子提供了可能。因此，天然产物全合成不仅代表着合成有机化学的最高水平，而且在小分子药物的研发中起着关键性作用。由不同类型的结构单元来合成次级代谢产物的重要生物学意义：不但扩展了天然产物结构的多样性，而且使生物合成途径的细节更加复杂化。三、功能【互作】（1）蛋白质：生命体内绝大多数功能依靠蛋白质相互作用实现；小分子通过干扰蛋白质互作来调控蛋白质功能，包括共价作用、离子（静电）相互作用、氢键、疏水相互作用和范德华相互作用。抑制作用：通常情况下有机小分子通过竞争性地域蛋白质的结合，抑制其正常生物功能的行使。抑制效果在很大程度上受限于蛋白质-蛋白质之间的接触面，对其起决定性作用的区域叫做热点，其最重要的特征是功能和结构上的普适性。激活作用：（蛋白水解酶、激酶、脱乙酰酶、磷酸化酶和核酶）四种主要途径：1）结合到蛋白质催化结构域的变构部位上，导致蛋白质的构象发生变化，从而激活整个蛋白。2）结合到蛋白质催化结构域的变构部位上，激活蛋白质的翻译后修饰过程。3）结合到蛋白质的调节亚基上，间接激活蛋白质的催化结构域。4）结合到蛋白质的调节亚基上，促进蛋白质的寡聚化。（2）核酸：非共价（干扰其功能）：1）与螺旋表面的静电结合。2）与大沟或小沟内的碱基对边缘发生相互作用3）在碱基之间的嵌入作用。共价：1.DNA的烷基化作用2.活性自由基对核酸链的断裂作用 生物大分子的进化：自然界中的生物大分子进化指的是DNA，RNA，蛋白质等生物大分子的功能从无到有，从简单到复杂，从低级到高级发展的过程。物种进化的过程实际上是无数大分子功能的进化。大分子多样性的原因：1.生物体内有数量庞大的基因，转录翻译产生了数量相当可观的蛋白质2.RNA存在着复杂的剪切过程，可以对同一个基因序列进行不同的剪切操作，表达产生不同的蛋白质；甚至不同的基因也可以通过RNA剪切后合并从而表达新的蛋白；体内存在大量