《现代生物物理学-黎明》exercise3_2015.pptVIP

习题一 驻留时间分析I : 用单分子荧光方法观测分子结合动力学 磁镊 magnetic tweezer 测力的原理 Chap6, P216, 6.7, 6.10 * 用FRET方法监控分子A和B（各带一个荧光基团）的结合过程，反应方程如下。A、B未结合时无荧光信号，一旦结合为复合体AB则将产生荧光信号。实验中B的浓度可控，A的浓度远小于B。当实验对某个固定的A分子进行监控时，测量到的荧光信号的时间轨迹符合标准二态系统的特征。 问题：如何推断出结合速率常数 及解离速率常数 。 左图所示为单分子操纵中常用的磁镊装置，长链高分子（如DNA）的一端固定在衬底上，另一端共价连接到一个微米大小的顺磁微珠上。磁珠受磁场作用并对高分子施加拉力，该力的方向始终沿Z方向。该装置可直接记录磁珠的空间位置，但不能直接测量力的大小。理论分析表明，可以通过测量微珠在x-y平面中的位置涨落 来间接地计算磁珠所受的力。高分子在恒力f作用下沿Z方向伸长，首末端距在Z方向的投影为L（即 ，可直接观测）。 习题二 磁镊如何测力？ 1，假设高分子可视为长度为L的硬杆。证明外力f与磁珠位置在x-y平面内的涨落 具有如下关系：f 2kBTL/ 。 2**，上述结论可用高分子的自由连接链模型进行严格证明。设链节长为b，共N链节，N 1。 （1）计算分子在外力F作用下的配分函数，并计算L。