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- 2016-09-19 发布于重庆
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CASTEP使用
CASTEP
前言
CASTEP模組提供了一個完整且容易使用的介面來操作CASTEP/CETEP計算物理與化學程式,這一個介面允許你使用Cerius2 Visualizer所提供的交談式圖形介面與模擬環境來有效的發揮CASTEP的量子力學功能
註解
雖然CASTEP主要是用於大尺度的週期性系統,他也可以被應用在以超晶格建力起來的缺陷表面介面與分子,更進一步的資訊請參照42頁的”非週期系統”已獲的更進一步的資訊。
CASTEP模組允許你使用含有彈性的分子模型工具,Cerius2模型環境所提供的進階的GUI來產生與設定模型以便研究,定義你要進行計算工作的形式,並且在本地端的機器或遠端的機器執行它。
你的CASTEP run一跑完,你就可以使用CASTEP模組的分析工具來抽取及檢視由CASTEP所產生的原始輸出資料。這原始輸出結果藉由大量的數據來描述你模型的性質。
動態使用介面
雖然機制羯大部份是明顯的,Cerius2 透過由使用者介面建立的好幾個CASTEP輸出輸入的資料檔來與CASTEP產生聯繫。你所要執行的job上設定的選項會被用來產生一個檔案,此檔案會被傳送到CASTEP做為輸入。
如果CASTEP完全執行成功,結果會被寫入輸出檔案,CASTEP模組分析工具會去讀取這些檔案,由原始的資料輸出,抽取並整理出更加容易讀的資訊。
CASTEP理論
這個CASTEP套件是具有模擬金屬,絕緣體或半導體的電子鬆弛到基態的能力。使用這個技術,CASTEP可以計算作用在原子的受力和單位晶格上的應力。原子上來的受力己經被用來找出平衡的結構或進行模擬分子動力學(使用正則系綜或微正則系綜) 。
前言
CASTEP的理論基礎是電荷密度泛函理論在局域電荷密度近似或是梯度修正的版本,這是由Perdew 和 Wang所發展的GGA。DFT所描述的電子氣體交互作用被認為是對大部分的狀況都是夠精確的,並且他是唯一能實際有效分析週期性系統的理論方法。請看第三章一般理論來或的更進一步的DFT理論。
在CASTEP裡預設的設定是GGA,它在很多狀況下被知道是比較好的方法。梯度修正的方法在研究表面的過程、小分子的性質、氫鍵晶體以及有內部空間的晶體(費時)是比較精確的。眾所皆知,LDA會低估分子的鍵長(or鍵能)以及晶體的晶格參數,而GGA通常會補救這缺點。然而,有許多證據顯示GGA會在離子晶體過度修正LDA結果;當LDA與實驗符合得非常好的時候,GGA會高估晶格長度。因此要推薦一個對所有系統都是最好的特定方法是很困難的。
膺勢
電子-離子間的交互作用可以用膺勢的觀念來描述。對於每種元素而言,CASTEP提供了一套的的位勢:
位 勢延 伸 檔 名ultrasoft.uspnorm-conserving potential使用Lin et al.最佳化方法來產生.recpotnorm-conserving potential使用Troullier-Martins 最佳化方法來產生.pspnc未最佳化硬的norm-conserving potential使用Teter 方法來產生.psp
Norm-conserving位勢這個方法理論是相當有名的而且是經徹底驗證的。在這樣的方法之中,pseudo波函數在定義的核心區域的截止半徑以上是符合all – electron 波函數的。在截止半徑之內,pseudo波函數沒有結點,且和norm-conserving條件之 all - electron波函數連結在一起:也就是說他們的帶著相同的電荷。在使相當高截止能量代價之下這些膺勢可以相當高的精準度被做出來。Teter位勢便是具有如此的特性但是這個相當硬的膺勢。最佳化的方法,特別是林等人的方法,允許軟的norm-conserving 位勢的產生,然而描述第一列(碳,氮,氧)或過渡金屬(鎳,銅,鈀)等局域化價電子軌域的所需之截止能量仍然經常還是太高。
Vanderbilt 所提出來的超軟膺勢的想法是不用釋放非收斂性條件用這樣的方法來產生更軟的位勢。在這各方法裡頭虛波函數在核心範圍是被允許作成盡可能越軟,以致於截止能量可以被大大的減小。技術上而言這是靠著廣義的正交條件來達成的。為了要重建整個總的電子密度,波函數平方所得到電荷密度必須在核心範圍在加以附加額外得密度進去。這個電子雲密度因此就被分成兩各部分拉,第一部分是一個延伸是整各單位晶包平滑部分,第二部分是一個局域化在核心區域的自旋部分。前面所提的附加部分是只出現在密度,並不在波函數。這和像LAPW那樣的方法不同,在那些方法中類似的方式是運用到波函數。
超軟位勢有另一個除了比non-conserving更軟的好處。USP產生演算法保證了在預先
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