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- 2017-03-07 发布于重庆
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文献检索---让您白手起家(pubmed篇)
文献检索让您白手起家 pubmed篇
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文献检索让您白手起家 pubmed篇
PubMed检索系统简介 / zt PubMed系统是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)开发的用于检索MEDLINE、PreMED-LINE数据库的网上检索系统。MEDLINE是美国国立医学图书馆(U.S.National Library of Medicine)最重要的书目文摘数据库,内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、卫生保健和基础医学。收录了全世界70多个国家和地区的4000余种生物医学期刊,现有书目文摘条目1000万余条,时间起自1966年。
PreMEDLINE是一个临时性医学文献数据库。它每天都在不断地接受新数据,可为用户提供基本的文献条目和文摘,其文献条目在标引和加工后每周向MEDLINE移加一次。
pubmed还通过电子通讯方式接受出版商提供的文献条目数据,这种条目带有[MEDLINE record in process]的说明,并标有[Record as supplied by publisher]的标识。这种条目每天都在不停地向PreMEDLINE数据库中传送,但其中有些条目由于超出了MEDLARS数据库的收录范围,将永远不会被PreMEDLINE或MEDLINE条目所取代,例如在综合性的科学杂志(Science或Nature)上发表的地理学文章
pubmed 系统的主要特点
1.词汇自动转换功能(Automatic Term Mapping) 在PubMed主页的检索提问框中键入检索词,系统将按顺序使用如下4种表或索引,对检索词进行转换后再检索。
(1)MeSH转换表(MeSH Translation Table),包括MeSH词、参见词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的MeSH词和TextWord词(题名词和文摘词)进行检索。例如:键入“Vitamin h,系统将其转换成Biotin [MeSH Tems] OR Vitamin h [Textword]后进行检索。
(2)刊名转换表(Journal Tanslation Table),包括刊名全称、MEDLINE形式的缩写和ISSN号。该转换表能把键入的刊名全称转换为“MEDLINE缩写[Journal Name]后进行检索。如:在检索提问框中键入:“new england journal of medicine, pubmed将其转换为N Engl J Med [Journal Name]后进行检索。 (3)短语表(Phrase list)。该表中的短语来自MeSH、含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统(UMLS: Unified Medical Language System)和补充概念(物质)名称表[Supplementary Concept Substance Name]。如果PubMed 系统在MeSH和刊名转换表中未发现与检索词相匹配的词,就会查找短词表。
(4)著者索引(Author Index)。如果键入的词语未在上述各表中找到相匹配的词,或者键入的词是一个后面跟有1~2个字母的短语,pubmed即查著者索引。如果仍然找不到匹配词,pubmed就会把该词断开后再重复上述自动词汇转换过程,直到找到与键入的词语相匹配词语为止。若仍然没有匹配词,单个词会被联一起(用AND)在全部字段中检索。如:single cell,系统就会自动将其分成两个词:“single“和“cell”检索,其检索表达式为:“single AND cell”。要查验检索词的转换情况,可点击“Details”键。
2.截词检索功能
pubmed 允许使用“*”号作为通配符进行截词检索。如:键入“bacter *”,系统会找到那些前一部分是bacter的单词(如bacteria, bacterium, bacteriophage等),并对其分别进行检索。如果这咱词少于150个,pubmed会逐个词检索,若超过150个(如:Staph*),pubmed将显示如下警告信息:“Wildcard search for term* used only the first 150 variations. Lengthen the root word to search for all endings。截词功能只限于单词,对词组无效。如:“infection*”包括“infections”,但不包括“infection control”等。使用截词功能时,PubMed系统会自动关闭
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