生物信息学 第5章 常用分析软件.ppt

蛋白质的卷曲螺旋—coiled-coil 卷曲螺旋是蛋白质空间结构中的一种，它是由2 ～ 7个α螺旋相互缠绕而形成超螺旋结构的总称。卷曲螺旋区域一般由7个氨基酸残基为单位组成，以a、b、c、d、e、f、g位置表示，其中a和d位置为疏水性氨基酸，而其他位置的氨基酸残基为亲水性。许多含有卷曲螺旋结构的蛋白质具有重要的生物学功能，例如基因表达调控中的转录因子。 含有卷曲螺旋结构最知名的蛋白质有原癌蛋白（oncoprotein）c-fos和jun，以及原肌球蛋白（tropomyosin）。 利用COILS分析蛋白质的卷曲螺旋 COILS是由Swiss EMBNet维护的预测卷曲螺旋的在线工具，该软件是基于Lupas算法，将查询序列在一个由已知包含卷曲螺旋蛋白结构的数据库中进行搜索，同时也将查询序列与包含球状蛋白序列的PDB次级库进行比较，并根据两个库搜索得分决定查询序列形成卷曲螺旋的概率。COILS也可以下载到本地进行运算。 其网址为：/software/COILS_form.html COILS在线网页 用COILS分析GO45_HUMAN卷曲螺旋的图形显示结果 用COILS分析GO45_HUMAN卷曲螺旋的文本显示结果 * * * 第5章 常用分析软件 一、基因结构 基因的概念是随着遗传学、分子生物学、生物化学等领域的