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- 2016-10-20 发布于重庆
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第6章隐马尔科夫链模型2
后验解码问题
前面我们介绍了在给定一个符号序列时,在不同的可能状态序列中找出概率(可能性)最大的状态序列(或路径)。在实际情况中可能会碰到一个问题:不同的路径其概率相差不大,这为我们选择哪一条路径增加了一定的困难。但我们知道一条状态序列,它是由各个位置的状态组成的,比如图6-11中,从第1个位置到第45个位置均由状态F组成,紧接后面的21个是L状态,依此类推。因此克服上述困难我们可以每个位置各个不同状态的概率,这里面我们必须分清一点:某一条序列对应于某个状态序列的概率含义与状态序列中某个位置上具体某个状态的概率是不同的,我们将它们的区分总结于如图6-14:
图6-14 某个DNA序列对应的不同可能的CpG岛分布(状态序列)的概率与各个位置上某个状态的概率之间的区别(“+”代表CpG岛区域;“-”代表非CpG岛区域)。
我们在上节的“Viterbi”算法中重点介绍的是如何计算图6-14中右边部分,并将其中最大的概率对应的路径找出来。而我们这一节要介绍的是如何计算图6-14中最下面的概率,这就是通常我们所说的“后验解码问题”:计算概率为多少?
为了计算这个概率,首先得介绍所给定序列对应的概率,由于不同的状态序列可以产生同一条序列,因此,我们有图6-15的描述:
图6-15 隐马尔克夫链中符号序列的概率与路径的关系(这里假设符号序列集只有两条序列与,对应的状态序列(路径)中也
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