ChemDraw的使用方法 【基本功能篇】
ChemDraw 是一款学化学的人基本都知晓的画结构式的软件,现已更名为ChemBioDraw
这是一款对于我们研究化学的人来说不可缺少的软件之一,但是能够完整使用它所有动能的人,我想应该很少吧?当然,笔者也是其中之一。
所以,也为了自我学习,就写了一下这篇文章。当然,这篇文章可能无法完全涵盖chemdraw所有的功能,这点也请大家见谅(^_^;)。
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前言
有了ChemDraw,我们就能准确的画出标题图这么好看的结构式。但是chemdraw不是免费使用的,要买正规版还是需要花点钱。虽然在中国,大家都用破解版,笔者在这里还是推荐大家尊重知识产权,能够尽量花钱买正版。如果你只是一个大学生,为了写一下作业的话,有两款免费的软件推荐,它们是MarvinSketch和ChemSketch。当然,如果是专门的研究人员,或者硕士博士的话,还是建议买一个完整版。
笔者现在用的是ver.13。本文主要以这款进行说明探讨(2015年1月开始ChemDraw的最新版本是ver.14)。如果仅仅是画一些结构式的话,版本的更新之间的差异不是特别大。
接下来在这里主要介绍一些使用频率比较高的菜单。
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FILE 菜单
File菜单打开的话,除了保存等功能以外,也可以对页面进行一些设定。
Open Style Sheets : 因为默认的样式表画出来的结构式并不是很漂亮,所以首先选择你想投的杂志所对应的结构式。初学者的话一般推荐ACS格式。具体的在后面会介绍
Document Setting :可以进行包括结构式的各种样式的设定。
Layout : 在布局方面,经常在画到一半的时候,页面空余不够了。这个时候我们就可以点击Document SizeHeight?Width把操作页面扩展后,确保有足够的空间供我们作图。
Drawing ?: 在真正画图的时候经常需要调整的地方我想应该是化学键的长宽间距等等(Bonds), 下图给出了可以更改的具体的一些项目以及其代表的含义。
Text Caption、Atom Labels : 该选项用于更改字体的大小。图通的文本设置在Caption里,原子大小设定请用Label选项。
Colors : 当然背景色跟图的颜色肯定也是可以修改的,但是笔者建议白黑搭配显得更加清晰简洁,当然各有所好。
Apply Document Setting From : ?如果你想使用其他的样式设定的时候所使用的选项。 点开选择最上方的other选项的话,可以选择你自己以前设定使用过的样式。这样一来,就可以方便的把用于powerpoint、poster、word各种文件的区分开来,是特别简便的一项功能。
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EDIT 菜单
该菜单主要用于复制、修改与一些图片等等的插入。当然其中还涵盖了ChemDraw自带的一些功能。
Copy as : ?把分子结构式转换成SMILE文字序列或者SLN文字(下图所示)序列,可以把这些文字复制到剪贴板用于复制粘贴。
Paste Special : 与Copy as相反、把文字列转换成分子结构式。
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Get 3D Model : 把平面结构式转换成三维模型。转换出来的模型双击后可以用Chem3D进行再次编辑。
Insert File : 用于插入外部的一些图像文件,是十分有用的一个选项。
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VIEWS 菜单
用于切换各种工具窗口的开/关。
Show Crosshair Rulers : 显示十字线、标尺。主要便于调整化合物的位置。
Show Main、General、Style Toolbar : 这三项在画结构式的时候很有用,一般都需要点开显示出来。
Show Analysis、Chemical Properties : 当画完化学结构时候,用于预测化学物理性质等数据(分子mol量,分子质量分布,沸点等等)。该选项一般是必用项目。
Show Character Map : 当需要使用希腊字母等特殊文字的时候使用的选项。当然Symbol字体也可以代用,但是在这里点开的话更加一览无余,更方便查找插入。
Show Chemical Warnings : 在画结构式时可以检查出你的原子价态是否出现问题,一旦出现问题,它会自动以红色标出提醒。
Actual Size, Fit to Window, Magnify, Reduce : 调整画面表示的倍率。 Actual Size表示100%的倍率。Fit to Window就如字面意思一样,调整到契合窗口大小。Magnify是扩大。Reduce就是缩小的意思。
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?OBJECT 菜单
该菜单用于多个化合物之间的位置关系的调整,以及化合物的一些修饰美化等。
Fixed Lengths An
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