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基础分子生物学
第一章
1.DNA的发现
Avery的肺炎双球菌转化实验
Hershey和Chase的噬菌体侵染细菌试验
2.基因工程操作的工具
原核生物的基因组和染色体结构都比较简单,转录和翻译在同一时间和空间内发生,基因表达的调控主要发生在转录水平。
原核细胞染色体:?
?
整个染色体DNA几乎全部由功能基因和调控序列所组成。?
几乎每个基因序列都与它所编码蛋白质序列呈线性对应关系。
2.真核生物
?真核生物染色体中相对分子质量一般大大超过原核生物,并结合有大量的蛋白质
DNA具体组成成分为:组蛋白、非组蛋白、DNA。
?其蛋白质与相应DNA的质量之比约为2:1。
组蛋白组蛋白是染色体的结构蛋白,其与DNA组成核小体。根据其凝胶电泳性质可将其分为H1、H2A、H2B、H3及H4。
组蛋白的特性:进化上极端保守性。其中H3、H4最保守,H1较不保守。
无组织特异性.
肽链上氨基酸分布的不对称性.
组蛋白的修饰作用。包括甲基化、乙基化、磷酸化及ADP核糖基化等。
富含赖氨酸的组蛋白H5.
7.非组蛋白
??染色体上除了存在大约与DNA等量的组蛋白以外,还存在大量的非组蛋白。
??非组蛋白的量大约是组蛋白的60%~70%,非组蛋白的组织专一性和种属专一性。
??非组蛋白包括酶类、骨架蛋白、核孔复合物蛋白以及肌动蛋白、肌球蛋白等。它们也可能是染色质的组成成分。
??几类常见的非组蛋白:
??HMC蛋白。一般认为可能与DNA的超螺旋结构有关。
??DNA结合蛋白。可能是一些与DNA的复制与转录有关的酶或调解物质。
??A24非组蛋白。位于核小体内,功能不详。
真核细胞基因组最大的特点是有大量的重复序列,而且功能DNA序列大多被不编码蛋白质的非功能DNA所隔开,这就是著名的“C值反常现象”。?
?C值:一种生物单倍体基因组DNA的总量。??
真核生物C值是随着生物进化而增加,高等生物的C值一般大于低等生物。某些两栖类C值大于哺乳动物
真核生物DNA序列大致可分为3类:
??不重复序列、中度重复序列、高度重复序列——卫星DNA。。
9.真核细胞染色体的结构四级分别为:
??核小体:核小体是由H2A、H2B、H3、H4各两个分子生成的八聚体和由大约200bpDNA组成的。八聚体在中间,DNA分子盘绕在外,而H1则在核小体的外面。每个核小体只有一个H1。(10纳米纤维)
??螺线管:螺线管每一螺旋包含6个核小体,压缩比为6。这种螺线管是分裂间期和分裂前期染色体的基本组分。(30纳米)
??超螺旋圆筒:中期染色质是一细长、中空的圆筒,由3螺线管缠绕而成,压缩比为40。
??染色单体:由超螺旋圆筒再压缩5倍而成。
10.真核生物基因组的结构特点总结归纳
??真核基因组庞大,一般都远大于原核生物的基因组。
??真核基因组存在大量的重复序列。
??真核基因组的大部分为非编码序列,占整个基因组序列的90%以上,该特点是真核生物与细菌和病毒之间最主要的区别。
??真核基因组的转录产物为单顺反子。
??真核基因是断裂基因,有内含子结构。
??真核基因组存在大量的顺式作用元件。包括启动子、增强子、沉默子等。
??真核基因组中存在大量的DNA多态性。DNA多态性是指DNA序列中发生变异而导致的个体间核苷酸序列的差异,主要包括单核苷酸多态性(SNP)和串联重复序列多态性两类。
??真核基因组具有端粒结构。
10. 原核生物基因组:
??原核生物基因组很小,大多只有一条染色体,且DNA含量少。如大肠杆菌DNA仅4.6Mb,完全伸展总长约为1.3mm,含4000多个基因。
??从基因组的结构来看,原核细胞DNA有如下特点:
??结构简练。非编码序列极少,这与真核细胞DNA冗余现象完全不同。
??存在转录单元。多顺反子mRNA。
??有重叠基因。同一段DNA含有两种不同蛋白质的信息。
11.DNA作为遗传物质的主要优点:
??信息量大,可以缩微
??表面互补,电荷互补,双螺旋结构说明了精确复制机理
??核糖的2’脱氧,在水溶液中稳定性好
??可以突变,以求进化
??有T无U,基因组得以增大,而无C脱氨基成U带来的潜在危险。(尿嘧啶DNA糖苷酶可以灵敏识别DNA中的U而随时将其剔除)。
DNA的一级结构 Watson和Crick于1953年提出了著名的DNA双螺旋模型。 脱氧核苷酸之间由3’→5’磷酸二酯键连接成DNA链,两条链的碱基通过氢键实现AT、GC配对。 DNA的二级结构
DNA二级结构是指两条多核苷酸链反相平行盘绕所生成的双螺旋盘绕结构。
DNA有三种构象:A-DNA、B-DNA、Z-DNA,其中AB为右手构象,Z为左手构象。
B型为普遍存在的结构。 DNA的高级结构
DNA的高级结
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