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1质粒DNA的提取
实验一 质粒DNA的提取 目的与要求 通过质粒的一些特性、质粒DNA的提取、测定,学习用碱变性法提取质粒DNA, 了解用分光光度计测定DNA含量的方法。 质粒 独立于染色体外的,能自主复制且稳定遗传的遗传因子。是一种环状的双链DNA分子。 存在于细菌、放线菌、真菌以及一些动植物细胞中,在细菌细胞中最多。 载体 用于携带重组DNA,并且能够使外源DNA一起复制与表达的质粒(运载工具)。 具备的条件: 易于鉴定; 在受体细胞中可以独立复制; 易于筛选; 易于导入受体细胞。 质粒结构 抗性基因(Antibiotic resistance gene,such as Ampicillin resistance gene, Kanamycine resistance gene) 启始复制子(ori, Origin of replication); 多克隆位点(MSC, Multiple cloning site or polylinker); 标记基因(Marker gene, such as LacZ gene)。 实验原理 碱裂解法提取质粒是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。在pH值介于12.0~12.5这个狭窄的范围内,线性的DNA双螺旋结构解开而被变性,尽管在这样的条件下,共价闭合环状质粒DNA的氢键会被断裂,但两条互补链彼此相互盘绕,仍会紧密地结合在一起。当加入pH4.8的乙酸钾高盐缓冲液恢复pH至中性时,共价闭合环状的质粒DNA的两条互补链仍保持在一起,因此复性迅速而准确,而线性的染色体DNA的两条互补链彼此已完全分开,复性就不会那么迅速而准确,它们缠绕形成网状结构,通过离心,染色体DNA与不稳定的大分子RNA,蛋白质-SDS复合物等一起沉淀下来而被除去。 仪器、材料与试剂 [仪器 恒温培养箱 恒温摇床 台式离心机 高压灭菌锅 材料 1.葡萄糖 2.三羟甲基氨基甲烷(Tris) 3.乙二胺四乙酸(EDTA) 4.氢氧化钠 5.十二烷基硫酸钠(SDS) 6.乙酸钾 7.冰乙酸 8.乙醇 9.盐酸(HCl) 10.Bt菌株 11.吸头、小指管 试剂 溶液I 50mmol/L 葡萄糖 5 mmol/L 三羟甲基氨基甲烷(Tris)Tris·HCl 10mmol/L 乙二胺四乙酸(EDTA)(pH8.0) 溶液II 0.4mol/L NaOH , 2% SDS ,用前等体积混合 溶液III 5mol/L乙酸钾 60mL 冰乙酸 11.5mL 水 28.5mL TE缓冲液 10mmol/L Tris·HCl 1mmol/L EDTA(pH8.0) 70%乙醇(放-20℃冰箱中,用后即放回) 离心,10000r/min,7min,上清移入另一干净离心管,并加1ml 100%乙醇混匀,12000r/min离心5min,弃去上清液; 沉淀用70%乙醇清洗一次,小管倒置于吸水纸上,除尽乙醇,室温自然干燥; 加入30-50?l灭菌蒸馏水或TE 缓冲液溶解提取物,室温放置15-30min,使DNA充分溶解(有时需要酚:氯仿抽提); 将分离出的质粒DNA置于-20℃保存备用。 注意: 用移液器(俗称“枪”)操作时,每一步都要格外小心,以免切碎DNA(包括质粒DNA和基因组DNA); 加入溶液II 和III后,一定不要剧烈振荡,避免导致基因组DNA的断裂而污染质粒DNA!!! 实验报告 目的与要求 实验原理 材料与方法 结果与讨论 * 将实验菌株按1:100接种于新鲜的LB液体培养基 37℃振荡培养过夜 取1.5ml培养物 离心收集菌体 弃去培养液,使细胞沉淀尽可能干燥 实验步骤 细菌沉淀 + 100μL solution I 是一种等渗缓冲溶液,内含葡萄糖以降低剪切力 剧烈振荡 加200μL溶液II(新鲜配制) 裂解细胞,强碱溶液中质粒和染色体DNA变性 快速颠倒5次(轻柔) 冰上放置5min 加150μL溶液Ш 中和质粒DNA复性 冰上放置5-10min 颠倒6-7次混匀 *
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