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第一章
1.寄主的限制和修饰现象:细菌能将外来的位点上切断,从而保证其不外来噬菌体所感染,而其自身的染色体被一种特殊的酶所修饰而得保护,这种现象叫做
2.1限制性核酸内切酶Ⅱ类酶特点:识别位点严格专一,并在识别位点内将2.2Ⅱ类限制性核酸内切酶命名:属名一个字母(
2.3限制性核酸内切酶的星号活性:高浓度的酶、高浓度的甘油、低离子强度、极端pH值等,会使一些限制性核酸内切酶的切割序列发生低特异性,这种性质称为限制性核酸内切酶的星号活性(限制性内切酶在含20℃稳定保存)2.4部分酶切:
2.5同尾酶:识别位点不同但切出的DNA片段具有相同的末端序列6同裂酶:来源不同,识别序列相同,切割位点可以相同(同序同切酶)也可以不同(同序异切酶),存在位点偏爱现象。
1甲基化酶:许多Ⅱ类限制性核酸内切酶都相应存在着相对的甲基化酶,它们可修饰限制性核酸内切酶识别序列中某位碱基甲基化,从而使
用途:就是在必要时可以封闭某一限制性核算内切酶的切口。
命名:在对应的限制性内切酶名字前面加
甲基化对限制性核算内切酶的影响:
3.2 T4-DNA连接酶:在实验中绝大多数情况下使用的是DNA连接酶,具有粘性末端和平末端。目前商品化的连接酶:借助’-OH和’-P之间形成的磷酸二酯键
3 S1核酸酶:来源于米曲霉菌,其特征如下:
RNA,降解
2.降解发生的方式为内切和外切,产生带5’磷酸的单核苷酸或寡核苷酸
pH4.0-4.5的酸性环境,且为2+所激活
5.酶量过大时会降解双链核酸,因为双链降解活性比单链低5万倍
3.4 DNA聚合酶Ⅰ:
·5’-3’聚合酶活性——聚合作用
’-5’外切酶活性——校对作用
·5’-3’外切酶活性——切除修复作用(切口平移)
Klenow酶:是大肠杆菌5’-3’外切酶活性,基因工程中常用该酶填平’突出的粘性末端5末端脱氢核苷酸转移酶():不需要模版只需要带’羟基末端引物的’末端
6碱性磷酸单酯酶:能将’端磷酸基团切除。
1载体:指运载外源DNA在体外重组成
4.2载体应具备的条件:
2.具有合适的限制性内切酶位点
3.具有合适的选择标记基因,用来筛选重组体DNA
4.能接纳尽可能大的外源4.3拷贝数:一种质粒在一个细胞中存在的数目
4多克隆位点:许多限制酶的切点
严紧型复制:除了受本身的复制机制的控制外,还受染色体的严紧控制。
·质粒的复制是同宿主细胞的复制偶联同步的
·在每个细胞中的质粒只有一份拷贝,或最多只有几份拷贝
松弛型复制:只受本身的遗传结构的控制,而不受染色体复制机制的约束
·宿主细胞不合成蛋白质时,松弛型质粒仍继续进行复制,每个宿主细胞中通常具有较高的拷贝数()
·在增殖松弛型质粒时,总是要让宿主菌经氯霉素处理抑制蛋白质的合成
不相容性:两种质粒不能共存于同一受体细胞内
1λDNA载体及类型
载体的构建:缩短长度→删除重复的酶切口→加装选择标记→构建琥珀型密码子的突变体
载体类型:插入型&取代型
2λDNA包装和限制
·包装蛋白在宿主细胞内合成,包装蛋白首先结合在cos区的附近,形成包装启动复合物,因此cos区对包装至关重要
·包装时由一个蛋白因子将cos区交错切开,从而保证只有一个DNA线状分子被包装在一个噬菌体内,每个宿主细胞可包装多达100个成熟的λDNA分子
·包装对105%,5kb,也就是说可以
·包装好了的
7.考斯质粒及其特点
·含有
·由于·将这一小片段9kb),同时它仍可像λDNA一样在体外被包装成具有感染活性的噬菌体颗粒,并高效感染大肠杆菌
·不能在体内被包装,更不能裂解细胞,其制备与质粒相同
·进入细胞后,完全依靠质粒上的复制子进行复制
·含有多种单一酶切位点,便于克隆
DNA片段的连接
定向克隆;外源
粘性末端:(不同粘性末端的连接)
突出末端相同(’突出):Klenow酶补平之后连接相同(’突出)用切平,之后再用。
Klenow酶补平之后连接
平末端:属于分子内的连接,反应速度要比粘性末端的连接慢得多
方向:用Klenow补平或者用同聚结尾法都是从’-3’,切’突出用’突出用
9.提高重组率的方法:
()
()载体分子在连接前先除磷
()用T加装人工粘性末端
10.1转化子:
10.2重组子:3转化率:产生菌落的总数定义每载体最佳转化条件下进入受体细胞的分子数
12.1转化:将质粒为载体构建的重组
12.2转染:将噬菌体(病毒)
12.3转导:以噬菌体颗粒为媒介转移
13.1抗菌性筛选法(ex环丝氨酸筛选)
·最常见的载体携带的标志是抗药性标志,如抗氨苄青霉素()、抗四环素()、抗卡那霉素(kanr)等
·当培养基中含有抗生素是,只有携带相应抗药性基因载体的细胞才能生存繁殖
·如果外源目的序列是插入在载体的抗药性基因中间使这抗药性
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