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在石家庄跟世界一流较劲,韩春雨“一鸣惊人”.doc
在石家庄跟世界一流较劲,韩春雨“一鸣惊人”
令人吃惊的是,河北科技大学副教授韩春雨团队的研究优于麻省理工、哈佛、斯坦福等名校的同行
2016年5月2日,韩春雨与合作者的文章终于发表了―先被《科学》(Science)审稿小半年后拒稿,后历时9个月终被《自然生物技术》(Nature Biotechnology)接收。
接下来的几天里,他每天都会收到几十上百封来自同行的邮件,但并非每封都能及时回复。
“实验室人手有限,处理不过来那么多邮件,还望同行海涵。”韩春雨在电话里说,满是歉意。他和合作者发明的新的基因编辑技术,正引起国内同行的热切关注。他们纷纷追问:“谁是韩春雨?” 更精确,效率更高
42岁的韩春雨是河北科技大学副教授,因为新发表的工作“一鸣惊人”。
简单地说,韩春雨团队发明了一种新的基因编辑技术(NgAgo-gDNA),适合在人类细胞中基因组编辑,不同于已有最时兴的技术(CRISPR-Cas9)。后者通过RNA寻找替换序列,而新技术通过DNA作为介导寻找替换目标。
NgAgo是短语Natronobacterium gregoryi Argonaute的简称。韩春雨团队就是利用格氏嗜盐碱杆菌(Natronobacterium gregoryi)的Argonaute实现了DNA引导的基因组编辑,并发现NgAgo作为一种DNA介导的核酸内切酶,适合在人体细胞中进行基因组编辑。
Argonaute作为一个核酸内切酶家族,最早由荷兰瓦赫宁恩大学的约翰-范德欧斯特研究组证明这一家族的同源蛋白酶活,可以有效地利用单链脱氧核糖核酸作为短介质,去相对精准地切割基因组靶点。
范德欧斯特的这一发现开启了基因组工程的新篇章,因为之前的大多数基因组工程研究是基于RNA的(CRISPR-Cas9、TALEN等,锌指蛋白是基于DNA的但是没有实现可编码的优势),哈佛大学分子与细胞生物系副研究员段昕认为,“这一进展给大家引入了一个新的思路去进一步改造”。 韩春雨对自己的工作很有自信
目前世界各个实验室最为流行的基因编辑工具是CRISPR-Cas9。从原理上来说,早期的DNA编辑技术是通过蛋白(如锌指蛋白)来寻找需要替换的序列,Cas9则是通过RNA(引导RNA,即gRNA)来寻找替换的序列,由于比操作蛋白质简单得多,Cas9技术迅速被广泛使用。
但是,Cas9需要19个配对的碱基,并且要求在需要编辑的基因组上这19个碱基后面必须紧邻一个符合一定特征的三碱基序列(PAM序列),这在一定程度上限制了gRNA的设计,而NgAgo?CgDNA系统不需要PAM序列,拓宽了其设计范围。
NgAgo结合24个碱基的gDNA,比Cas9的gRNA(19个碱基)要长5个碱基,理论上其精确性要提高1024(4的5次方)倍。DNA编辑相当于在一本书中的某个位置找到一个单词将它替换成另一个单词,并且要保证书中其它地方的单词不被替换。显而易见,如果替换的是the这样的简单单词,那么可能从书中找到多个地方,而找pneumonoultramicroscopicsilicovolcanoconiosi这样的单词则不太可能找错。
韩春雨团队的研究还发现,NgAgo?CgDNA系统对向导序列-靶序列错配容忍度很低。gDNA上任何一个碱基的变换都会降低NgAgo的切割效率,如有三个错配则使其完全失活。这在另外一个机制上提高了NgAgo使用的精确性,特别是一些富含GC序列的地方,NgAgo系统比Cas9系统效率更高。
韩春雨团队在论文中还介绍,与Cas9相似,Argonautes在基因表达抑制及抵御外源核酸中起关键作用。但是,Argonautes在许多方面不同于Cas9。比如,Cas9只存在于原核生物中,而Argonautes在进化过程中保守,存在于几乎所有生物体中;尽管大多数的Argonautes结合单链(ss)RNAs,在RNA沉默中起重要作用,一些Argonautes却可以结合ssDNAs并切割靶DNA;正确的Cas9结合要求向导RNA必须有一个3′RNA-RNA杂化结构,Argonaute结合则不要求特异的一致的向导RNA二级结构;Cas9只可以切割PAM上游的靶序列,而Argonaute不要求靶序列上存在特异的序列。当Argonaute与向导序列结合时,它们可以影响彼此的生物化学特性,并作为一个整体起作用。
“因此,从理论上说,NgAgo的脱靶率更低”,韩春雨说。 荷兰瓦赫宁恩大学约翰-范德欧斯特研究团队 “幸好NgAgo足够给力”
韩春雨是石家庄人,本科毕业于石家庄的河北师范大学,他父母也在该校任教。
1995年,韩春雨来到北京,先在中国农业科学院攻读硕士学位,后在中国协和医科大学(中
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