超算在生物医药领域的应用.docxVIP

鍦???超算在生物医药领域的应用???钑???魐?魧卢 宇 彤QOPU?釱国家超级计算广州中心 主任 中山大学 数据科学与计算机学院 教授 博导 国防科学技术大学 计算机学院 教授 博导yutong.lu@01超算中心介绍OUTLINE主要内容0203?魐QOPU??釱魧04??钑??鍦?目前应用概况???未来拓展方向总结国家超级计算广州中心NATIONAL SUPERCOMPUTER CENTER INGUANGZHOU21、超算中心介绍? 超级计算机对科学发现、技术创新、产业革命的重要作用– 高性能计算：是科学研究的三大手段之一鍦???– 大数据处理：正成为科学研究的第四范式??? 世界各国争相角逐超级计算机系统的主导地位?钑???魐QOPU??釱魧31、超算中心介绍? 天河二号超级计算机系统?国家863计划和核高基重大专项的标志性成果，2013年6月研制成 功，位列世界超算Top500排行榜第一位??? 国家超级计算广州中心钑???? 广东省、广州市、国防科技大学魐QOPU??、中山大学联合共建釱魧? 2014年4月对外试运行?2015年8月20日，经广州市委常委会审议通过，由中山大学负责 广州超算中心的运行管理鍦????41、超算中心介绍性能54.9PFlops / 33.86PFlops系统16000结点, 1.4PB内存机柜125+8+13+24=170 (720m2)能耗17.8 MW (1902MFlops/W)制冷密闭水风冷APM机框(16 x cn)TH-2 系统机柜(8 x 机框)机柜63机柜12432个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点NRMNRMNRMNRMNRMNRMNRMNRMBTMBTMBTMBTMTH-Net576端口交换机0576端口交换机i576端口交换机j576端口交换机12SWMMSWMSWMSWBTMBTMBTMBTMSWMMMMSWSWSWNRMNRMNRMNRMNRMNRMNRMNRM32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点32个计算节点机柜0机柜62计算主板IONPhi#48000IVBCPM#32000FT-1500#4096服务处理自主cpu阵列商用cpu计算阵列系统服务飞腾计算结点计算结点结点飞腾计算结点计算结点登录......结点...飞腾计算结点计算结点登录飞腾计算结点计算结点结点管理IO服务结点IO服务结点结点加速存储IP存 存 存 存IB存 存 存 存共享存储商用cpu计算阵列IO增强计算结点分IO增强布计算结点式...本地IO增强化计算结点存IO增强储计算结点IO存 存 存 存大规模混合层次式并行存储系统12.4PB1、超算中心介绍? 天河二号的创新– 异构多态体系结构鍦– 自主定制互连网络????– 层次式加速存储架构??– 高效自治的软件栈钑?– 高密度高精度结构工艺??魐?? 世界超级计算机Top500魧排行榜 “六连冠”2013.6~至今釱QOPU?? 世界共轭梯度HPCG排行榜“四连冠”2014.6~至今61、超算中心介绍目标与定位：具有中国特色的世界一流超算中心大科学大工程??钑???科学研究平台魐?QOPU?交流合作平台釱魧鍦????新产业技术创新平台学科建设平台人才培养平台72、目前应用概况1.面向学术前沿基础研究–大科学重大创新成果2.面向国家重大发展战略??钑?–大工程重大应用突破??魐QOPU??3.魧面向地方经济社会发展釱–产业转型升级新动力鍦????华南地区（天气尺度）82、目前应用概况?应用分类– 高性能计算应用– 云计算应用??– 大数据应用钑????总体情况?QOPU?魐釱魧– 用户数量目前已超过1200家– 支撑国家级课题超过400项– 广东省／广州市课题超过80项鍦????2、目前应用概况—超算与生物医药组织器官的模拟– 腹主动脉瘤– 心脏瓣膜跟血液的相互作用??钑?2.??魐QOPU??釱魧鍦????药物研发– 使用分子对接技术发现HIV-1蛋白酶抑制剂2、目前应用概况—超算与生物医药3. 人类基因组相关研究4. 人工智能医生– 基因组装– 全基因组重测序及相关应用??– 广泛应用于癌症治疗、钑???产前检查等魐QOPU??釱魧?– 病历、影像、文献分析鍦??–? 协助医生提供个性化的 癌症治疗方案2、目前应用概况—超算与生物医药?主要应用– 药物研发鍦– 健康医疗????– 生物信息学??– 生物分子动力学模拟钑???魐?总体情况魧?QOPU?釱– 生物医药领域用户数量目前已超过160家– 主要集中在药物研发、健康医疗、生物信息学，以及生物分子动力学相关的模拟上，分别占比16%、27%、26%和