Genediagnosis概要
基因诊断 Gene diagnosis 基因诊断 1、定义:利用现代分子生物学和分子遗传学的技术方法,直接检测基因结构及其表达是否正常,从而对疾病作出诊断。 4、特点: 1)针对性强 2)高度特异性 (杂交技术、探针) 3)灵敏度、精确性高 4)早期快速诊断 5)适用性强、诊断范围广 (内、外源基因或非活化基因) 5、临床意义及优缺点 1)临床意义: 疾病分型 优生优育 组织配型 鉴别病原体的基因型、明确病原 2)缺点: 一、分子杂交 依据DNA双链碱基互补、变性、复性的原理,检测样品中是否存在与其互补的同源核酸序列。 (一)探针(probe) 1、定义:一段与被检测的核苷酸序列互补的带标记的核苷酸片段。 (二)种类 1、基因组DNA探针 基因组文库中,选取外显子序列,避免高度重复序列。 2、cDNA探针 理想 3、寡核苷酸探针 人工合成的探针,适合点突变分析,反应需时短。 20-50bp; G-C对40-60%; 探针内部无互补序列; 4bp,同一碱基4个连续出现; 避免与非靶序列同源(〈70%或连续8个碱基相同)。 4、RNA探针 较少应用,易降解,不易操作,多由cDNA经体外转录得到 特点: 1)RNA/RNA、RNA/DNA稳定性 DNA/DNA,特异性高 2)无互补链,杂交效率高 3)无高度重复序列,非特异性杂交少 4)杂交后RNA可去除,降低本底。 (三)标记物 1、高度灵敏性 2、不影响碱基配对的特异性 3、不影响探针的主要理化性质、杂交稳定性和特异性,Tm无较大改变 4、酶标时,不影响Km、酶活性 5、特异性高、假阳性率低 6、化学稳定性高、保存时间长、操作简便、无污染、无害、价格低廉。 1、放射性核素 优点:灵敏性(10-14~10-18g)、特异性高。 缺点:放射性污染; 射线损伤探针分子; 半衰期短,随用随标,标记后立即使用; 稳定性差; 反应需要时间长。 常用放射性核素 (1)32p ATP a、g位标记 (2)35S (3)3H (4)125I 2、非放射性标记 特点:灵敏度低;稳定、安全、经济、实验周期短。 (1)生物素(biotin) 水溶性维生素,与尿嘧啶环C5相连 (2)地高辛(Digoxigenin,Dig)-免疫酶学检测 类固醇类半抗原,与尿嘧啶环C5相连, Dig-UTP、 Dig-dUTP 、Dig-ddUTP (3)荧光素;FITC 被UV激发出荧光观察,主要适用于原位杂交 (4) Amersham 公司ECL(增强化学发光自显影,enhanced chemiluminescence) Progema公司LightsmithTMII Luminescence Engineering System (5)光密度、电子密度标记物 金 、银 (四)标记方法 1、体内标记法(in vivo) 2、体外标记法(in vitro) 酶促标记法 化学标记法 杂交方法 固相杂交 相关技术:印迹技术(blotting) (一)核酸分子杂交(hybridization ) Southern blot:将电泳分离的DNA片段转移到固相支持物上 Northern blotting: 将电泳分离的RNA片 段转移到固相支持物上 斑点或狭缝杂交法(dot blotting) 原位杂交(tissue in situ hybridization) 等位基因特异性寡核苷酸探针杂交法(allele specific oligonucleotide,ASO) DNA芯片技术(DNA chip, DNA array, DNA microarroy) 菌落杂交法 夹心杂交法 杂交信号的检测 一、放射自显影: 二、非放射性探针的检测 1、偶联反应 :免疫反应与显色体系 2、显色反应: 酶促显色法 碱性磷酸酶 (AP)BCIP/NBT 辣根过氧化物酶(
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