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质粒DNA的提、纯化与鉴定
石河子大学
生物化学实验
姓名:侯云鹏
专业:作物遗传育种
学号:2013107014
学院:农学院
质粒DNA的提取、纯化与鉴定
侯云鹏
(石河子大学农学院,新疆 石河子 832000)
摘 要:采用碱裂解法提取大肠杆菌质粒DNA,然后对提取的质粒DNA进行琼脂糖凝胶电泳分析,并用凝胶电泳成像系统进行拍照、分析。结果表明碱裂解法提取的质粒DNA纯度和产量高,且重复性好,具有结果稳定的特点,达到了分子生物学的实验要求。
关键词:质粒DNA;碱裂解法;琼脂糖凝胶电泳
前言
质粒是一类存在于细菌染色体之外,能够独立复制并稳定遗传表达的双链环状DNA分子。大小从1Kb至200Kb以上不等,且携带抗生素、耐重金属等重要性状的筛选基因,以超螺旋状态存在于寄主细胞中。质粒主要发现于细菌、放线菌和真菌细胞中,能在子代细胞中保持恒定的拷贝数,并表达所携带的遗传信息,它可将有用的外源基因通过基因工程的手段送入细胞中繁殖和表达,是分子生物学实验中常用的工具。
质粒DNA这种基因运载工具在分子生物学中有着极为广泛的应用前景,而质粒DNA的提取、纯化与鉴定是分子生物学实验中经常使用的最基本的工作。质粒DNA的提取效率和纯度直接影响到分子生物学实验的成功与否,比如酶切、连接、大肠杆菌的转化、PCR扩增等。从细菌中分离质粒DNA的方法一般包括3个步骤:培养细菌,使质粒DNA大量扩增;收集和裂解细菌;分离和纯化质粒DNA。目前,分离制备质粒DNA的方法很多,其中常用的方法有碱裂解法、煮沸法、SDS法、羟基磷灰石层析法等。在实际操作中可以根据宿主菌株类型、质粒分子大小、碱基组成和结构特点以及质粒DNA的用途进行选择。本实验采用碱裂解法提取质粒DNA,并用琼脂糖凝胶电泳分析。
1材料与方法
1.1实验材料
含有pUC19质粒的大肠杆菌
1.2实验仪器
恒温培养箱、恒温摇床、高速离心机、漩涡振荡器、超净工作台、高压灭菌锅、微量加样器、烧杯、量筒、玻璃杯、微波炉、天平、电泳梳子、电泳槽、电泳器、紫外灯、
1.3实验试剂
①溶液Ⅰ:50mmol/L葡萄糖、25mmol/L三羟基甲基氨基甲烷(Tris)Tris-HCL (pH8.0) 、10mmol/L乙二胺四乙酸(EDTA) pH8.0、高压蒸汽灭菌20min后,4℃保存。
②溶液Ⅱ:0.4mol/L NaOH、2%SDS(用时等体积混合,现配现用),注意:SDS易产生气泡,不要剧烈搅拌。
③溶液Ⅲ:60mL 5mol/L KAc 、11.5ml冰醋酸、28.5mLH2O (该溶液钾离子浓度为3mol/L,醋酸根离子浓度为5mol/L)。
④TE缓冲液:10 mmol/L Tris-HCL(pH8.0)、1 mmol/L EDTA(pH8.0)。
⑤氯仿: 异戊醇(24:1) 将量取加入24ml 氯仿和1ml异戊醇,充分混合后,移入棕色玻璃瓶中,4℃保存。
⑥LB培养基(1000ml):每升含胰化蛋白胨 10g,酵母提取物 5g,NaCl 15g,琼脂粉(固体培养基时用) 15g,用10M NaOH调pH为7.0,高压灭菌20min后,4℃保存。
⑦70%乙醇
⑧琼脂糖
⑨1L 5×TBE备用溶液:54g Tris,27.5g 硼酸,20ml 0.5mol/L EDTA ,调pH 8.0。
⑩6×加样缓冲液:0.25% 溴酚蓝、40%蔗糖。
其它试剂有:胰RNA酶、DNA Marker、硼酸、Goldview 试剂。
1.4实验方法
1.4.1质粒DNA的提取
①取1.4 ml 含pUC19的大肠杆菌培养物于1.5ml 微量离心管中,6000r/min 离心2min,吸取上清液,并使细胞沉淀尽可能干燥;
②加100 ul 溶液Ⅰ悬浮细菌沉淀,强烈振动以充分混和均匀,冰浴室温放置5min;
③加200 ul 溶液Ⅱ,盖紧管口,轻缓上下4-6次颠倒离心管以混合内容物,冰浴室温放置5min;
④加150 ml 溶液Ⅲ,盖紧离心管口后上下轻缓颠倒4-6次,置冰上10 min;
⑤12000 rpm离心10 min,转移上清液至另一离心管;
⑥向上清液中加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),反复混匀,12000 rpm 离心10 min,取上清液移至另一离心管中;
⑦加2倍
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