上机实习四：BLAST序列相似性搜索工具的使用.pptVIP

上机实习四：基本局部比对搜索工具blast的使用  * Step 1: Choose your sequence Sequence can be input in FASTA format or as accession number BLAST搜索的4个步骤 ①选择你所感兴趣的序列号或序列，将它粘贴到BLAST的输入框中。 ②选择一个BLAST程序(blastp，blastn，blastx，tblastx，tblastn)。 ③选择一个用于搜索的数据库。一个通常的选择是去冗余 (nr)。 ④为搜索和输出格式选择可选参数。 Example of the FASTA format for a BLAST query Step 2: Choose the BLAST program Step 2: Choose the BLAST program blastn (nucleotide BLAST) blastp (protein BLAST) tblastn (translated BLAST) blastx (translated BLAST) tblastx (translated BLAST) Step 3: choose the database nr = non-redundant (most general database) dbest = datab