RNA基因2) Word 文档.docVIP

00000000000000000000000000000000000第2命题： RNA基因 吴乃虎 （中国科学院遗传与发育研究所） 黄美娟 （北京大学生命科学学院细胞遗传学系） 一直以来，有关的科学工作者总是把大量的精力集中于蛋白质编码基因的研究，而对终产物为非编码RNA（non-coding RNA,ncRNA）的RNA基因的研究，则没有给于应有的重视。因此迄今为止，我们掌握的有关RNA基因的结构与功能的知识，远不及DNA和蛋白质的水平。 但是，随着基因组全测序工作的蓬勃发展，尤其是人类基因组研究工作的深入，迅速地改变了人们对RNA基因的认识。令人惊讶的是，近年来应用微阵列技术（microarrays）和高通量转录本测序技术（high-thraughput transcript sequencing）进行的全基因组分析显示，至少有85%甚至可能超过90%的人类基因组序列具有转录的活性。由此转录生成的数万个不同的非编码的RNA转录本，包括新发现的先前尚未鉴定的小分子量调节RNA（tiny regulatory RNA）。最新资料指出，人类基因组至少有6,000个RNA基因，同时随着研究的深入，这个数字还会不断地增加。除此之外，人类基因组中还存在着数量庞大的RNA基因的假基因拷贝。 一、 转运RNA（tRNA）基因 编码终产物为转运RNA的基因，称为tRNA基因。无论是原核生物还是真核生物，在排列形式上tRNA基因常常是聚集成簇并分布在基因组的不同部位。例如在非洲爪蟾基因组中，一段3.1kb的区域就集中排列着8个tRNA基因。在大肠杆菌中，有些tRNA基因是单拷贝的，另外一些tRNA基因则是多拷贝的；真核生物的情况有所不同，它所有的tRNA基因都是多拷贝的。 1. tRNA基因的结构特点 在tRNA基因转录序列区中，有一个长度约为14-60bp的内部启动子或称内部控制区。与5S rRNA基因的内部启动子不同，tRNA基因内部启动子分为A区和B区，分别位于8-19和52-62核苷酸的位置。因此被称为断裂启动子。 此外，还发现在某些真核生物tRNA基因前体转录本（pre-tRNA）中，还具有不同长度的内含子。例如酵母的400个tRNA基因中，有40个左右紧挨反密码子的3，一侧存在着一个内含子。tRNA基因内含子的长度，要比断裂基因前体转录本（pre-tRNA）的短，并且不存在相关的保守序列。 2. pre-tRNA的加工 大肠杆菌tRNA基因的排列方式，经常是数个聚集在一起共转录生成一条大分子量的前体tRNA（pre-tRNA），接着经过切割作用释放出许多个含单个tRNA基因的tRNA序列片段。由此产生的不同的tRNA分子，需要按照诸如切割、剪接、碱基增加和修饰等不同方式的加工处理，才能形成具功能活性的成熟的tRNA。真核生物pre-tRNA的加工方式与大肠杆菌的类似（图2-48）。 不过需要提醒，不同的pre-tRNA具有不同的加工方式，因此对所有tRNA都适用的普遍性的加工方式是不存在的。图2-46所示仅是其中的一种例子。 3. 人体tRNA基因 据推测人体总共有46种不同类型的tRNA分子，分别参与对应于20种标准氨基酸的61种有义密码子的解码作用。然而人体tRNA基因的数量与蛋白质氨基酸使用频率之间并不存在严格的相关性。例如使用频率仅占全部人体蛋白质氨基酸的2.25%的稀有氨基酸胱氨酸，具有多达30个专有的tRNA基因，而使用频率高达全部人体蛋白质氨基酸6.1%的脯氨酸，却只有21个专有的tRNA基因。 虽然tRNA基因似乎是分散地分布在全部基因组的各个部位，但其分布密度却是不均匀的。典型的例子如人体tRNA基因，有超过半数以上（273个）是存在于6号和1号染色体，而且大部分是聚集在6p2的一段长4Mb的区域中。此外还发现30个半胱氨酸tRNA基因中，有18个是聚集在7号染色体的一段0.5Mb的窄小区域中。 二、 核糖体RNA（rRNA）基因 在不同物种的生命体中，存在着不同数量的rRNA基因拷贝，除大肠杆菌的为单拷贝的之外，其余物种的大多都是多拷贝的。在同一物种的生命体中，同一种rRNA基因的所有拷贝都是相同的或者说是几乎相同的。 以大肠杆菌为代表的原核生物，由三种不同的rRNA基因分别编码16S、23S和5S rRNA。这三种rRNA基因分开排列在同一条DNA区段上，并共转录生成一条30S的前体rRNA转录本（pre-rRNA）。随后此条30S的pre-rRNA在甲基化酶的作用下，便会在诸多位点发生甲基化作用。于是经过切割和修饰之后可释放出16S、23S和5S三种rRNA，以及若干额外的tRNA分子。 2. 真核生物rRNA基因 在新陈代