聚类分析应用精选.pptVIP

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  • 2016-12-09 发布于湖北
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* * * * * * * * * 六、差平方和法(Ward法 ) 反映样品之间的差异程度 设变量X的n个样品观察值为: n个样品的离差平方和为:qp k 设类p和q分别含有np、nq个样品,其离差平方和分别记为 和 直观上容易想到把两群样品聚为一大群,大群的离差平方和将超过原来两个群的离差平方和之和。 如果将p和q并类得到新类k,则类k的离差平方和为 把增加的量记为 定义类p和q之间的距离为: 设类p和q分别含有np、nq个样品,其离差平方和分别记为 和 可以推得新类 k与任一类 r 的距离:②   ③   ④   ⑤ ① ② ③ ④6.55213013644.5110.5122.518202 计算5个样品两两之间的距离 记为距离矩阵 (采用欧氏距离), 2. 合并距离最小的两类为新类,按顺序定为第6类。  ⑥= 例 离差平方和法(Ward法)两样品间的距离的平方恰为它们之间欧氏距离平方的一半。 3、计算新类⑥与各当前类的距离, 得距离矩阵如下:  ②   ③    ⑥ ① ② ③  6.552176.6744.5154.6724.67 为最小, ⑦   ⑥⑦ ③ ⑥  24.6762.17245.264、重复步骤2、3,合并距离最近的两类为新类,直到所有的类并为一类为止。为最小,⑧ 5、 6、按聚类的过程画聚类谱系图 4 5 ⑥ ⑨ ⑧ 并类距

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