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蛋白质组学研究概况 主 要 内 容 基本概念 蛋白质组研究的意义和背景 国内外蛋白质组研究概况 蛋白质组研究进展 蛋白质组研究主要技术 蛋白质组研究现状与前景 一、基 本 概 念 蛋白质组：根据 MR Wilkins等的定义，“Pro-teome”来源于protein和genome, 意思是：pro-teins expressed by a genome，即由一个基因组表达的全套蛋白质。Swanbanks则指出“pro-teome”代表一完整生物的全套蛋白质。 Kahn P则认为“proteome”反映不同细胞的不同蛋白质组合。故“proteome”是指：一个基因组，一种生物或一种细胞/组织所表达的全套蛋白质。 一、基 本 概 念 蛋白质组学（Proteomics）：以蛋白质组为研究对象，研究细胞内所有蛋白质及其动态变化规律的一门学科领域。 功能蛋白质组（Functional Proteome）：指在特定时间、特定环境和实验条件下基因组活跃表达的蛋白质。 功能蛋白质组学(Functional Proteomics)：研究细胞内与某种功能有关或在某种条件下的一群蛋白质 。 二、蛋白质组研究的意义 了解生命现象本质：基因组仅大概给出人类及其他生物基因的数量，但没有给出基因的功能； 解释疾病的发生机制：正常情况和非正常情况细胞表达蛋白的差异及产生的后果； 诊断疾病：根据蛋白表达的差异及统计学的结果，对疾病进行诊断； 治疗疾病：对疾病的治疗提出方案，发现药物靶点，设计新药； 通过不同生物蛋白质组研究生物进化、利用其他生物为人类服务。 二、蛋白质组研究的背景 人类基因组和其他许多生物基因组测序工作飞速发展； 已经测序的推测基因有40-60%都未明编码蛋白质功能； 1994年Williams和Wilkins首先提出蛋白组； 蛋白质的生物合成是多级调控和后修饰的； 生命现象不是靠单蛋白反映其复杂性和可变性； 生物技术的发展为蛋白质组研究提供了条件。 三、国内外蛋白质组研究概况 3.1 蛋白质组研究的开端 1994年Williams和Wilkins首先提出蛋白质组概念；1995年由Wasinger等首篇关于proteom的研究论文发表于Electrophoresis杂志；1996年澳大利亚建立了第一个蛋白质组研究中心; 1997年Cordwell和Humphery-Smith提出功能蛋白质组概念。 三、国内外蛋白质组研究概况 3.1 蛋白质组研究的发展速度与规模 三、国内外蛋白质组研究概况 研究机构：澳大利亚：2家；丹麦：1家；美国：2家。 参与国家：1995年 —— 一家（澳）；1997年 —— 美，丹，2瑞，英，法，日，意和德等。 国际知名学府：哈佛，斯坦佛，耶鲁，密执安，华盛顿大学，欧洲分子生物学实验室，巴斯德研究所，瑞士联邦工业学院。 三、国内外蛋白质组研究概况 3.2 研究材料 原核微生物（支原体） ? 单细胞真核生物 （酵母）? 多细胞真核生物（线虫）? 人体正常组织和病理标本。 3.3 研究范围 A. 蛋白质；B. 基因； C. 重要生命活动的分子机制； D. 医药靶分子寻找与分析。 三、国内外蛋白质组研究概况 3.4 国外研究现状： 根据2001年5月23日公布的结果，已有67种生物体的基因组全序列完成，包括11个古细菌，41个细菌和15个真核生物。此外，还有208个原核生物和152个真核生物基因组正在测序；2002年3月报道已有600种生物基因组完成测序工作，其中170种为真核生物。 三、国内外蛋白质组研究概况 国际方面： A. 1997年构建成第一个完整的蛋白质组数据库——酵母蛋白质数据库（YPD）；1997年举行了第一次国际“蛋白质组学”会议。 B. 各国政府加大资金投入：美国国立研究院在密执安医学院投入$1000万建立有关肺、直肠、乳腺和卵巢等肿瘤蛋白质组数据库；欧共体资助酵母蛋白质组研究；英国资助3个研究中心对已完成或即将完成的基因组序列进行蛋白质组研究；法、德、澳、日等投入巨资。 三、国内外蛋白质组研究概况 C. 各商业公司对蛋白质组研究进行巨额投资： 当今世界上 一些大制药集团如Ciba-Geigy和Sandoz合资建立的Novartis公司，投资$2.5亿建立基因研究所；Glaxo-Wellcome在基因组研究领域投入$ 4700万，研究人员增加一倍；Smith Kline公司花$1.25亿扩展人基因组的测序。 独立完成人类基因组测序的Celera公司投资近亿美元；日内瓦蛋白质公司与布鲁克质谱仪公司联合成立了国际