实习二：两条序列比对及蛋白质三维结构预测.docVIP

实习二： 两条序列比对及蛋白质三维结构预测 学号 姓名 专业年级 实验时间 提交报告时间 实验目的： 1. 学会使用EMBOSS软件包的 NEEDLE和 WATER进行两条序列比对 2. 通过PRSS理解两条序列比对得分的显著性检验 3. 会使用SWISS-MODEL进行蛋白质三维结构预测 实验内容： 依据实验教材学会使用EMBOSS软件包在比对资源，能够使用全局局部的比对方法比对蛋白和核酸的序列；PRSS比对两条序列的p-value；及通过SWISS-MODEL系统的全自动及提供模板的方式预测蛋白的三维结构。 作业： 1. Align two nucleotide sequences of your interest with Needle and Water at EBI respectively. Interpret the alignments and explain the differences between the Needle and Water alignment results. Do the same procedure with two protein sequences