分子模拟教—2010.doc

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教 案 课程名称 分子模拟 授课题目(章、节) 第一章 授课教师 李慎敏 授课对象化学081-2 授课时间 9月2日 教学方法 讲授 选用教具 多媒体 授课内容提要及时间分配: 分子模拟的概况 共计2学时 介绍分子模拟内容、发展; 30分钟 今天的计算化学 介绍其当前应用 50分钟 纳米材料 药物设计 3.学时安排、考试形式和参考书目布置作业 15分钟 本节课重点:分子模拟的概念及其当前的应用 大 连 大 学 教学重点、难点及基本要求: 重点:分子模拟的概念及其应用 难点:四种分子模拟方法的关系与应用领域 基本要求:了解分子模拟内容 了解当今分子模拟的成功案例 教研室主任意见: 单元教学小结(经验效果、问题、改进措施、信息反馈等): 本教案以讲授一个单元(2—4学时)或一次实验(实习)为单位填写。填写要用钢笔,字迹要清晰、工整。按表项目逐一填写。 教 案 课程名称 分子模拟 授课题目(章、节) 第二章 授课教师 李慎敏 授课对象化学081-2 授课时间 9月9日 教学方法 讲授 选用教具 多媒体 授课内容提要及时间分配: 第二章 力场 共计2学时 1 课前讨论 10分钟 你所了解微观尺度物质(主要是分子)的物理量的数学描述方法 模型与模拟 10分钟 分子坐标 直角坐标、内坐标、PDB坐标 15分钟 4 力场 50分钟 力场的函数形式 常见力场 常用软件介绍 5 布置作业 5分钟 本节课重点:分子结构模型的数学描述方法和能量表述 大 连 大 学 教学重点、难点及基本要求: 重点:分子力场的构建方法,力场的表述形式及参数 难点:微观体系中原子、分子能量与力场的关系 基本要求:掌握力场的构建思想 了解常见力场及常用软件 教研室主任意见: 单元教学小结(经验效果、问题、改进措施、信息反馈等): 本教案以讲授一个单元(2—4学时)或一次实验(实习)为单位填写。填写要用钢笔,字迹要清晰、工整。按表项目逐一填写。 教 案 课程名称 分子模拟 授课题目(章、节) 第三章 授课教师 李慎敏 授课对象化学081-2 授课时间 9月 16 日 教学方法 讲授 选用教具 多媒体 授课内容提要及时间分配: 分子力学的应用 共计2学时 1复习上节课的内容 5分钟 2讨论作业情况 5 分钟 3 分子力学应用基础 20 分钟 1) 科学问题 2) 势能面 3) Hessian 矩阵 4 统计力学基本概念 30分钟 1)分布 2)最可几分布 3)玻尔兹曼分布下的内能和压力 4)经典配分函数的求解 5. 分子力学的应用 25 分钟 1)构象能 2)生成焓 3)模拟准备 6. 回顾本节课主要内容,布置本节课的作业,布置下节课的预习内容 5分钟 大 连 大 学 教学重点、难点及基本要求: 重点:势能面、最可几分布概念问题 难点:数学问题 (玻

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