第1章生物分子导论..ppt

-OH -COOH -CH3 -H （S）-乳酸 （R）-乳酸 1 2 3 4 5 6 L-葡萄糖 L-甘油醛 D-葡萄糖 D-甘油醛 注 意： R／S标记法与D／L标记法的依据不同。 R／S法依据与＊C相连的四个原子或原子团的大小顺序； D／L法依据与D－甘油醛的构型是否相同。 五、具有手性碳原子的分子 1. 具有一个手性碳原子的有一对对映异构体 同一种物质的左旋体和右旋体的旋光度大小相同，旋转方向相反，等量混合后组成的混合物称为外消旋体，常用“±”或“dl”表示。 外消旋体 ----无旋光性 消旋体的拆分 （三）生物分子相互作用的立体专一性 消旋物： 立体专一性：区分立体异构体的能力，手性酶 DL-乳酸，微生物只合成L-乳酸，化学法合成的是消旋型DL-乳酸，价格便宜一大半。 手性分子的生物作用 1、对映体生理活性差异 2、受体靶位：细胞（含手性蛋白质分子）的具有一定立体构型和构象的特定部位。 单一对映体的手性药物分子与受体靶之间互补。 （四）构象与三维结构 三维结构 构象：分子中所有原子的空间排列，由分子中单键自由旋转造成，分子的刚性与柔性造成了无数构象 构象体/构象异构体：某种特定的构象 简单烃类实例：乙烷的构象 H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H H 三维结构 透视式 三维结构 重叠式 交叉式 H H H H H H H H H H H H Newman投影式 重 叠 式 构 象 交 叉 式 构 象 交叉式构象内能最低，是乙烷最稳定构象。 二、环己烷的构象 1 3 2 6 5 4 H H H H H H H H 椅式构象 H 1 6 5 4 3 2 H H H H H H H H H H H 船 式 构 象 1 2 3 4 5 6 H H H H H H H H 2 3 4 5 H H H H H H H H H H H H 6 两个平面： C1，C3，C5共平面 ； C2，C4，C6共平面； 椅式构象 12个C-H键：6个a、e键分别为三上三下。 a、e 键相互转化 1 2 3 4 5 6 椅式构象 X射线晶体学--要求晶体 核磁共振---溶液中三维结构 二者相互补充 （五）三维结构的分子模型 P8 透视式 骨架模型 球棍模型 空间填充模型 *P9 表1-3某些生命元素的范德华半径和单键共价半径 三、生物结构中的非共价力 （一）静电相互作用 （二）氢键 （三）范德华力 （四）疏水相互作用（熵效应） 作用于分子间的力--非共价力 生物分子主要通过非共价相互作用行使功能 （一）静电相互作用 又称--离子键，盐键，或盐桥 P9 对环境敏感--水，特别是无机离子(Na,Cl,Ca,Mg)等使他明显减弱。 盐离子浓度对生物分子特别是蛋白质的构象发生重大影响 （二）氢键 1、氢键的形成： ⅰ当H原子与电负性很大的O、N等元素形成H－O、H－N共价键时，由于此时两元素的电负性相差较大，则共用电子对会强烈地偏向电负性大的F、O、N等原子一边，则H原子带正电荷。 ⅱ H原子核外几乎成了一个裸露的H原子核(质子)，体积很小,具有很强的正电场。当另一分子中的组成原子上有孤对电子时(如：O、N等），则相互吸引。这种通过H原子对另一分子中的孤对电子产生的电性吸引作用力称之为 — 氢键。 2、氢键形成的条件及特点： 条件： ①、分子中具有H原子，且H原子必须与电负性大，原子半径小的元素原子相结合(F、O、N)。 ②、与H形成氢键的分子中必须有半径小，电负性大，并有孤对电子的元素原子(F、O、N) 特点： ③、氢键的强度小E(F－H F) 28kJ·mol－1且： H－F：---H－F﹥F－H---OH2﹥O－H---O－H ﹥O－H---NH3﹥H2N－H----NH3。 ④、氢键具有方向性和饱和性 ∵氢键是H与另一分子中的孤对电子间的静电吸引，由于电子对是在一定空间方向运动的，∴氢键具方向性。H一但与某一孤对电子对作用形成氢键后就不能再与另一原子的孤对电子形成氢键这就是氢键的饱和性。 ①、当分子间形成氢键时，会增大分子间力，因此可使分子的熔沸点升高，蒸发热增大，(如卤化氢；H2O→H2Fe ；NH3→SbH3 ) 此外， 在有机羧酸、醇、酚、胺、氨基酸和蛋白质中也有氢键的存在。 3、氢键的形成对化合物性质的影响 ②、分子内氢键，则降低分子间力 使物质的熔沸点下降 (如HNO3等) ③、分子的聚合、结晶、溶解、水合及生命体内的一些性质也常与氢键的