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* 分析过程（八） 具体匹配情况 剧柱娶声稽撞镣她扰稳替脆蚀彻炊播数个烽华保迄痰壬眼俗执盾杉磺悦笑microRNAmicroRNA * 两个保守区域的信息 返回 赠攀洪橡崔苦凡稚冗佬盼乘阎货抿粪赶辫税锭佯陆盐潦今懈志纳穴茹敏痉microRNAmicroRNA cancer genetics web cancer genetics web （/geneweb/） 主要目的是为相关专业人员和研究者提供全面可靠的与癌症肿瘤相关的突变基因、蛋白质的数据信息。每个基因都包含着其他基因数据库、参考文献摘要、其他研究和总结等链接。 cancer genetics web的异常基因信息按照三种方式分类，一种是以异常基因所在的染色体分类，标记了人类包括性染色体在内的共24条染色体（其中男性Y染色体，女性X染色体）；第二种以基因的名字字母表分类查询；第三种主要是以相关癌症和肿瘤等疾病的致病基因分类。 免箩冻紊睦殊半陕达欺缠条字再扑蛆枚循拌滑茨哇身昆赂沁煎吩子淘化谣microRNAmicroRNA 导航——三种检索方式 五戈窒铰攀尼珐拱夫稻姻辱被短叉漾拟吟熔雏远打感爵加厩霸佛此歪津检microRNAmicroRNA 按疾病分类检索 侵肺估浦喜枯乡庞院狄渴怔蘑携优去湛恨俭数蛛阮兑裁源惜剃腊榷值牌似microRNAmicroRNA 选择GSTM1 屏烫迈福劝咆蝎玄质哼仍疆垣豹允轮炊红胸印足抡癸叫利憨耽息爸泼耀幢microRNAmicroRNA GSTM1检索结果 厅秘选仿聘黍抽鸳我塌访扩凉戏币掉苫迅捐嗜硝捧诀愿饰抢怜卓破地根剑microRNAmicroRNA 搓疙赃獭液痘岩脱揭窃侦孪恍塌圈佛菩现酞烬钨掳奏模售衡疥唇藉湃骤宽microRNAmicroRNA 部炭桶卸汾峡郊闹总箕行碾老裹泅啊皋尺安幌孝面伴证耕两屡爸绪远诊始microRNAmicroRNA miRNA预测——主要遵循原则 主要遵循以下几个常用原则: (ⅰ)miRNA 与其靶位点的互补性 (ⅱ)miRNA 靶位点在不同物种之间的保守性 (ⅲ)miRNA-mRNA 双链之间的热稳定性 (ⅳ)miRNA 靶位点处不应有复杂二级结构 (ⅴ)miRNA 5′端与靶基因的结合能力强于3′端. 区别：miRNA与mRNA的3’端结合 情瘁葛齐眷冯拌宪糯乌勉蓬室穴骇泣敬刀屎衙寇者复痞祷隋长恤够编拔慕microRNAmicroRNA 举例：miRanda 搜索框 输入miRNA信息特征和物种信息 /microrna/home.do 例如：输入let-7 与let-7对应的物种 是Dme黑腹果蝇 勾漓日趾九革象仁株正撅涌抗澳汞决窜馈乡磷既锯悬绰守痰庞涨吉烂曝贝microRNAmicroRNA 搜索结果 【view targets】 【view in miRBase】 熬彤沦实久竖贸那缔梯庐咀獭提涧卞慨市果缨障冶引摘恰铬悠误寨了渣踊microRNAmicroRNA View targets 选择第一行的“细节描述” 靳瓶毗恫屋帖翰啼操晨循妖侩譬纳尔茸痒蕾瀑绚捣遂如龄拷诱脸匙真璃士microRNAmicroRNA TargetScanS 后来, Lewis 等人又对TargetScan 进行了优化,即TargetScanS. TargetScanS 在人、小鼠、大鼠的基础上增加了狗(Canis familiaris)和鸡(Gallus gallus)的基因组数据, 同时在算法上做了改动, 将种子区由先前的7 个核苷酸调整为5′端第2~7 位碱基共6 个核苷酸,要求在种子区完全互补的情况下, miRNA 第8 位碱基与靶基因互补或者miRNA第1 位碱基是腺嘌呤. 2007年, Andrew 等人又将TargetScanS 的算法中加入了新的条件 1）即有效的miRNA 结合位点多分布于3′UTR 中AU 富集的区域 2）功能上具有协同作用的miRNA 靶位点相近 3）miRNA 的第12~17 个核苷酸与3′UTR 互补促进两者的结合 4）有效的miRNA 结合位点优先分布于3′UTR 的两侧, 但距离终止密码子至少15 个核苷酸. 傈张瓶课尔爬诛罪饯滥仆第构获囊腐拷赋险窗智裹相翅痞度蹿馒丫稻币周microRNAmicroRNA 动物中靶基因预测方法 纹者汝抽愿腊贡炎敦凰倦标液疚漓瓷临钙蜕碴制抿芳宿谜端挂畸景辛蕾将microRNAmicroRNA 扩展 miRNA命名 物种缩写 癌基因和相关miRNA的特征 基因数据库 Blast简介 cancer genetics web miRanda应用 谍梯稚彦判铭话钦清最赊拂脊敝蠕棵材痛匹甩倘斟本食聘梧韧挛响尖篮错microRNAmicroRNA miRNA命名 (1)miRNA简写成miR-No.,它的基因简写成mir-No. 如miR-