蛋白质-氨基酸和肽探究.pptVIP

§5、蛋白质的高级结构 一、蛋白质的三维结构 一）、蛋白质的二级结构 蛋白质的二级(Secondary)结构 是指肽链的主链在空间的排列,或多肽链主链中各个肽段形成的规则的或无规则的构象。 二级结构 肽链的主链在空间的走向 α-螺旋 β-折叠 β-转角 无规卷曲 肽链的二面角 P205 二级结构的数学描述： 环绕Cα—N键旋转的角度为Φ 环绕Cα—C2键旋转的角度称Ψ 多肽链的所有可能构象都能用Φ和Ψ这两个构象角来描述，称二面角。 可以用（ф,ψ）来描述肽链的二级结构 1.α螺旋 ?-helix p207 1）典型的α螺旋有如下特征：用3.613表示 ① 是一种右手螺旋 ② 每圈螺旋：3.6个a.a残基， 高度：0.54nm ③ 每个残基绕轴旋转100°，沿轴上升0.15nm ④链内氢键维持螺旋稳定 相邻螺圈之间形成链内氢键，氢键的取向几乎与中心轴平行。 ⑤肽键上N-H氢与它后面（N端）第四个残基上的C=0氧间形成氢键 ⑥氨基酸残基侧链R向外 3.613 (ns) 2 ）R侧链对α—螺旋的影响 R侧链的大小和带电性决定了能否形成α—螺旋以及形成的α—螺旋的稳定性。 ① 多肽链上连续出现带同种电荷基团的氨基酸 残基, ② Gly在肽中连续存在时。 丝心蛋白含50%Gly，不形成α—螺旋。 ③ R基大的AA（如Ile）连续存在时，不易形