LncRNA的作用机理学案.pptVIP

LncRNA对mRNA的作用机理 2014.12.29 LncRNA是什么？ 长链非编码RNA( long non- coding RNA, lncRNA)是一类转录本长度超过200 nt( 核苷酸单位)的功能性RNA分子, 可在表观遗传水平、转录水平和转录后水平调控基因的表达, 广泛参与机体的生理和病理过程。 LncRNA来源 (1) 蛋白编码基因的结构中断从而形成一段lncRNA (2) 染色质重组: 两个未转录的基因与另一个独立的基因串联, 产生含多个外显子的lncRNA (3)非编码基因在复制过程中的反移位产生lncRNA (4)局部的复制子串联产生lncRNA (5)基因中插入一个转座成分而产生有功能的非编码RNA LncRNA作用机制 1) 在编码蛋白基因的上游启动子区（橘色）转录，从而干扰邻近蛋白编码基因（蓝色）的表达（如酵母SER3基因）； 2) 抑制RNA 聚合酶Ⅱ，或介导染色质重构和组蛋白修饰，而影响基因（蓝色）表达； 3) lncRNA（紫色）与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，干扰mRNA的剪切，进而产生不同的剪切形式； 4) lncRNA（紫色）与编码蛋白基因的转录本形成互补双链，在Dicer酶作用下产生内源性的siRNA，调控基因的表达水平； 5) lncRNA（绿色）结合在特定蛋白质上调节相应蛋白的活性； 6) 作为结构组分与蛋白质形成核酸蛋白质复合体； 7) 结合在特定蛋白上从而改变该蛋白的胞质定位； 8) 可作为小分子RNA（如miRNA）的前体分子。 LncRNA对基因表达的调控 LncRNA可从染色质重塑、转录调控及转录后加工等多种层面实现对基因表达的调控 染色质重塑 Mercer T R et al.,2009 a) lncRNA通过招募染色质重塑复合物至特定的基因组位点使其发生催化活性。如HOTAIR21，Xist、RepA和Kcnqot1招募Polycomb complex至HoxD位点，使得X染色体或Kcnq1功能域的组蛋白H3 第27位赖氨酸发生3甲基化（me3K27），诱导异染色质形成，从而抑制该区域基因表达。 b) lncRNA通过多种机制进行转录水平调控。lncRNA结合到基因cyclin D1上，招募RNA结合蛋白TLS来调控蛋白CBP和p300的组蛋白乙酰转移酶活性，进而抑制cyclin D1转录。 c) 超保守增强子转录出lncRNA-Evf2，该lncRNA能激活转录因子DLX2，进而调控基因Dlx6转录。 d) DHFR次要启动子区域转录出的lncRNA与该基因主要启动子区域结合形成三聚体，抑制转录因子TFIID结合，从而使基因DHFR发生沉默。 e) 反义lncRNA能够与剪接体（splicesome）中锌指同源mRNA Zeb2的5剪切位点结合，使内含子未被剪切掉，而该内含子序列中保留有内部核糖体进入位点（IRE位点），翻译过程中识别并结合该位点，导致Zeb2基因表达和翻译。 LncRNA研究 lncRNA研究中非常关键的一步就是发现与特定疾病相关的lncRNA。现阶段，基因芯片技术发展趋于成熟稳定，通过设计不同检测lncRNA探针，筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。