microbiology--微生物的分类和鉴定学案.ppt

* * 现代的微生物分类学 (microbial taxonomy)已从原有的按微生物表型进行分类的经典分类学发展到按它们的亲缘关系和进化规律进行分类的微生物系统学(microbial systematics)。它具体的任务有三即分类（classificontion）、鉴定（indentification）和命名（namendature）。 第一节 通用分类单元 一、种以上的分类单位 （一）七级分类单位 界（Kingdom） 门（Phylum） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） （二）种的概念 微生物的种(species)是一个基本分类单元，它是一大群表性特征高度相似、亲缘关系极其相近、与同属内的其他物种有着明显差异的一大群菌株的总称。 二、学名 每一个微生物都有一个自己的专门名称。名称分两类，一是俗名；二是学名，它是某一菌种的科学名称，是按“国际命名法规”进行命名并受国际学术界公认的通用正式名称。 物种的学名是用拉丁词或拉丁化的词组成的。在一般的出版物中，学名应排斜体字，在书写或打字材料中，应在学名之下划一横线，以表示它是斜体字母。学名的表示方法分双名法与三名法两种。 (一)、双名法(binominal nomenclature) 双名法是指一个物种的学名右前面一个属名(generic name)和后面一个种名加词(specific epithet)两部分组成。 学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+现名定名年份 词首大写 词首小写 斜体字 正体字(一般省略) 大肠埃氏杆菌 Escherichia coli (Migula) Castellani et Chalmers 1919 学名=属名+种名加词+(首次定名人)+现名定名人+现名定名年份 词首大写 词首小写 斜体字 正体字(一般省略) e.g 枯草芽孢杆菌 Bacillus subtilis (Ehrenberg) Cohn 1872 (二)、三名法(trinominal nomenclature) 亚 种：subsepicies,简subsp,是进一步细分种时所用的单元，一般指除某一明显而稳定的特征外，其余鉴定特征都与模式种相同的种。 变 种：variety, 简var,亚种的同义词，在国际细菌命名法规种已不主张再用这一名字 双名法: 当某种微生物是一个亚种或变种时用的命名法。 苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种 Bacillus thuringiensis (subsp) galleria 学名=属名+种名加词+符号subsp或var+亚种或变种的加词 词首大写 词首小写 斜体字 正体字(可省略) e.g 酿酒酵母椭圆变种 Saccaromyces cerevisiae (var) ellipsoideus 斜体字(不可省略) 学名的发音 按规定，学名的发音应按拉丁字母发音规则，但是事实上，英、美学者经常按自己的语种来发音，且影响大。 Bacillus subtilis /ba:’sil/\s ’s/\tilis/ Aspergillus niger /?sp?:dЗil/\s ’naidЗ ?: / Escherichia coli /e? ?: ri:ki:a ’k?uli:’kl ai/ 第二节 微生物在生物界的地位 一、生物界的分类学说 两界 三界 四界 五界 六界 三域 1753年 1860年 1956年 1969年 1949年 1978年 德国动物学家E.H.Haeckel于1866年建议在动物界和植物界外，应加上原生生物界(单细胞及无核类)。 Conard(1939年)提议第三界称为菌物界(真菌核细菌)。 Dodson(1971年)建议称菌界(病毒、细菌、蓝细菌等)。 1969年，R.H.Whittaker在Science杂志上发表了一篇《生物界级分类的新观点》的论文。提出了五界学说。包括动物界、植物界、原生生物界(原生动物、单细胞藻类、粘菌等)、真菌界、原核生物界(细菌、蓝细菌)。 我国学者陈世骧(1979年)曾建议生物应分为三总界和五界，按生物历史发展的3个不同阶段分总界，再按生理、生态特征的差别来分界。 非细胞总界 原核总界 真核总界 Jahn等于1949年提出六界系统，包括后生生物界、后生植物界、真菌界、原生生物界、原核生物界和病毒界。 1996年，美国的P.H.Rave