《pajek.pptVIP

可视化工具  Pajek Pajek Pajek软件是由Vladimir Batagelj和Andrej Mrvar共同编写的，可以免费提供给非商业用途的用户。Pajek在斯洛文尼亚语中是蜘蛛的意思，该软件的Logo就是一只蜘蛛，暗示其具有网络绘制的功能。 Pajek Pajek是一种基于Windows的用于将大型网络可视化的社会网络分析软件，是基于图论、网络分析以及可视化软件等等发展而来的。它的特点是将信息可视化。它允许人们对大量抽象的数据进行分析。事实上人的创造性不仅取决于人的逻辑思维，同时取决于人的形象思维。海量的数据只有通过可视化变成形象，才能激发人的形象思维，才能在表面上看来是杂乱无章的海量数据中找出隐藏的规律，为科学发现、工程开发和业务决策等提供依据。 1、Pajek主要功能简介 Pajek中有Files和Net选项，与Ucinet软件中的Data和Transform选项对应。其中Files菜单还有一些常用功能，如Read（读取）和Edit（编辑）或者Sort（分类）等。Pajek文件与Ucinet数据文件在格式上类似，在形式上可以是邻接矩阵本身，也可以是对数据进行分区或聚类分析的结果。使用Net选项，可以对网络进行转置或简化处理。因为Pajek包括很多用来检测成份的命令，其他菜单选项也可以进行各种分区和聚类，它们是专门设计用来减少巨型网络的规模的。Pajek可以对一个巨大的网络进行分析和分区，然后对每个分区进行更细致的分析。 Pajek主界面 2、Pajek功能特点 Pajek可以对大型网络进行有效的分析。最显著的功能就是该软件可以在屏幕上绘出二维、三维甚至动态的社群图，并具有强大的图形生成和导出功能。与MDS类似，Pajek也使用弹性嵌入程序对结果图进行着色处理，确定标签，以便直观的突出网络关系的核心特征，还可以利用选项功能对社群图进行平面旋转或空间旋转，以便从不同的角度观察图形，同时也提供鼠标自由移动所生成的网络节点。所有的操作都可以精确细致的控制。 3、具体功能详细介绍 下面将结合具体的链接分析研究实例，来详细介绍Pajek在网络信息计量研究中的应用。 大学网站之间的学术信息交流是网络信息分析的一个重要方面。大学之间的学术信息交流情况是学术研究情况评估、大学科研情况评估，以及大学之间的交流活跃情况评估的一个重要考察指标。因此，选择大学网站之间的互链情况作为实际使用的案例。 3.1实例数据来源 本实例选取中国管理科学研究院武书连等人发布的《2008中国大学评价》中排名前50的大学的网站作为研究对象。截至2008年7月31日，借助Altavista搜索到了50个大学的网站之间所有的互链共22094条链。 3.2数据预处理 使用Altavista搜索到的链接数据，需要转化为Pajek软件所能够读取的格式。具体的转化主要包括两步： 将下载的链接文件转化为Excel格式的数据，该数据表示50所大学之间互链的下三角邻接矩阵。 将.xls格式的链接数据转化为可以被Pajek识别的.net文件：中国50所大学.net。 Excel格式的链接数据（部分） Pajek文件中国50所.net格式（部分） Pajek可识别的.net文件由两部分组成：Vertices（顶点）部分和Arcs（弧）部分。第一部分以“*Vertices”开头，“50”表示顶点数，以下依次为各顶点的信息。下面我们以第一条记录为例，详细解释Pajek文件中顶点信息的记录格式：“1”和“”表示该顶点的编号为1，名称为；“0.6909 0.4970”表示该顶点在可视化图中x、y轴的坐标值，该值可以由使用者自行设定或者省略。第二部分以“*Arcs”开头，表示各顶点之间的关系。我们仍然以第一条记录为例：“1 2 216.0000”表示编号为1与编号为2的顶点之间的链接数为216次。 3.3可视化成图功能 接下来就可以在Pajek中读取该文件。在菜单中选择File（文件）﹥Network（网络）﹥Read（读取），或者直接在窗口界面的左侧点击Networks（网络）栏中最左侧的打开按钮。 步骤1 在Pajek中读取文件：中国50所大学.net 步骤2 在Pajek菜单选取所需的成图算法 Pajek默认的成图方式是环形算法（circular）。除此之外，常用的成图算法还有Kamada-Kawai算法，Fruchterman-Reingold spring embedder算法。Fruchterman-Reingold spring embedder算法由Fruchterman和Reingold提出，将一个无向连通图看作是一个力学系统，其最终目的是要使力学系统达到平衡。 可以在Draw（绘图）﹥Draw（绘图）﹥Layout（布局）中