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通用转录因子(general transcription factors) 是RNA聚合酶结合启动子所必需的一组蛋白因子,决定三种RNA(mRNA、tRNA及rRNA)转录的类别。 转录调节因子分类(按功能特性) 通用转录因子 特异转录因子 特异转录因子(special transcription factors) 为个别基因转录所必需,决定该基因的时间、空间特异性表达。 转录激活因子 转录抑制因子 转录调节因子结构 DNA结合域 转录激活域 TF 蛋白质-蛋白质结合域 (二聚化结构域) 谷氨酰胺富含域 酸性激活域 脯氨酸富含域 最常见的DNA结合域: 锌指模体(zinc finger) 常结合GC盒 C=半胱氨酸;H=组氨酸;F=苯丙氨酸;L=亮氨酸;Y=酪氨酸;Zn=锌离子 图18-9锌指结构 碱性螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH) (a)独立的碱性螺旋-环-螺旋模体结构示意图;(b)bLHL模体二聚体与DNA结合的示意图。两个?-螺旋的碱性区分别嵌入DNA双螺旋的大沟内 常结合CAAT盒 常结合CAAT盒 3.碱性亮氨酸拉链(basic leucine zipper, Bzip) (a)碱性亮氨酸拉链模体结构示意图;(b)bZIP模体与DNA结合的示意图。两个?-螺旋上的亮氨酸残基彼此接近,形成了类似拉链的结构,而富含碱性氨基酸残基的区域与DNA骨架上的磷酸基团结合 五、转录起始复合物的动态构成是转录调控的主要方式 (一)启动序列/启动子与RNA聚合酶活性 (二)调节蛋白与RNA聚合酶活性 启动序列或启动子的核苷酸序列会影响其与RNA聚合酶的亲和力,而亲和力大小则直接影响转录起始的频率 真核RNA聚合酶II不能单独识别、结合启动子,而是先由基本转录因子与RNA聚合酶II形成一个功能性的转录前起始复合物。 图18-12 转录起始复合物的形成 真核RNA聚合酶Ⅱ在转录因子帮助下,形成转录起始复合物。 PolⅡ TFⅡH TAF TFⅡF TAF TAF TFⅡA TFⅡB TBP DNA TATA EBP TBP 六、转录后调控主要影响真核mRNA的结构与功能 (一)mRNA稳定性的影响真核生物基因表达 5?-端的帽子结构可以增加mRNA的稳定性 3?-端的poly(A)尾结构防止mRNA降解 RNA无论是在核内进行加工、由胞核运至胞浆,还是在胞浆内停留(至降解),都是通过与蛋白质结合形成核蛋白颗粒(ribonucleoprotein, RNP)进行的。 * * * * * * * * * * * 第十八章 基因表达调控 Regulation of Gene Expression 第三节 真核基因表达调控 Regulation of Gene Expression in Eukaryote 一、真核细胞基因表达的特点 ① 真核基因组比原核基因组大得多 ② 原核基因组的大部分序列都为编码基因,而哺乳类基因组中只有10%的序列编码蛋白质、rRNA、tRNA等,其余90%的序列,包括大量的重复序列功能至今还不清楚,可能参与调控 ③ 真核生物编码蛋白质的基因是不连续的,转录后需要剪接去除内含子,这就增加了基因表达调控的层次 ④ 原核生物的基因编码序列在操纵子中,多顺反子mRNA使得几个功能相关的基因自然协调控制;而真核生物则是一个结构基因转录生成一条mRNA,即mRNA是单顺反子(monocistron),许多功能相关的蛋白、即使是一种蛋白的不同亚基也将涉及到多个基因的协调表达 ⑤ 真核生物DNA在细胞核内与多种蛋白质结合构成染色质,这种复杂的结构直接影响着基因表达; ⑥ 真核生物的遗传信息不仅存在于核DNA上,还存在线粒体DNA上,核内基因与线粒体基因的表达调控既相互独立而又需要协调。 图18-5 真核生物基因表达的多层次复杂调控 二、染色质结构与真核基因表达密切相关 活性染色质 (active chromatin) 具有转录活性的染色质 超敏位点(hypersensitive site) 当染色质活化后,常出现一些对核酸酶(如DNase I)高度敏感的位点 (一)转录活化的染色质对核酸酶极为敏感 (二) 转录活化染色质的组蛋白发生改变 组蛋白结构及其化学修饰 (a)组蛋白与DNA组成的核小体;(b)组蛋白的氨基端伸出核小体,形 成组蛋白尾巴;(c)四种组蛋白组成的八聚体 组蛋白修饰对于基因表达影响的机制也包括两种相互包容的理论。即:组蛋白的修饰直接影响染色质或核小体的结构,以及化学修饰征集了其他调控基因转录的蛋白质,为其他功能分子与组蛋白结合搭建了一个平台。这些理论构成了“组蛋白密码”的假说。 组蛋白 氨基酸残基位点 修饰类型 功 能
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