生物化学6第六章RNA的生物合成和加工.pptVIP

ZhangJG-Biochemistry 第六章 RNA生物合成和加工（4学时） 第一节 DNA指导下RNA的合成（转录） 第二节 RNA转录后加工 第三节 RNA指导下RNA和DNA的合成 第四节 基因表达的调控 本章重点讨论RNA的生物合成（转录）、乳糖操纵子；对RNA的合成后加工、RNA的复制和逆转录、基因表达调控作简要介绍。 1、转录有关的几个概念和术语： 转录单位： RNA链的转录起始于DNA模板上的一个特定位点，终止于另一位点，从起始位点到终止位点的转录区域称为转录单位。 1个转录单位可以是1个基因，或多个基因 转录起始主要由DNA上的启动子（promoter）控制，控制转录终止的部位称为 终止子（terminator）。 基因：是能够表达和产生（蛋白质或RNA）的DNA片段。（基因是编码一条多肽链或功能RNA所必需的全部核苷酸序列） 1）根据产物类别，基因分为： 蛋白质基因 RNA基因 2）根据产物功能，基因分为： 结构基因（酶、不影响基因表达的蛋白质） 调节基因（阻遏蛋白、转录激活因子） DNA的有义链和反义链 一、 RNA聚合酶 转录所需的酶叫RNA聚合酶，与DNA聚合酶比较： 1） 都以DNA为模板； 2） RNA聚合酶原料为核苷酸； 3）合成RNA方向均为5′→3′方向； 4）都是需要依赖DNA的，聚合酶（DNA指导下的聚合酶）； 5）碱基配对规律（T配A，A配U，CG互配）； 6）聚合反应都是核苷酸之间形成磷酸二酯键，产物为多聚核苷酸链； 7） RNA聚合酶不需要引物，无校正功能。 RNA聚合酶催化的反应 二、启动子和转录因子 启动子（promoter）是指RNA聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA序列。 RNA聚合酶起始转录需要的辅助因子（蛋白质）统称为转录因子(transcriptional factor)。 利用足迹法（footprint）和DNA测序法可以确定启动子的序列结构。 启动子都存在保守的共同序列，包括： （1）RNA聚合酶结合位点（Pribnow框）－10区 （2）识别位点（Sextama框）－35区。 启动子序列编号： 规定：从转录的近端向远端计数，起点左侧为上游，用负值表示，起点前的核苷酸为-1；起点后为下游，用正值表示。启动子序列编号为负数。 例如：大肠杆菌RNA聚合酶与启动子 大肠杆菌RNA聚合酶与启动子示意图 原核生物启动子的结构 在原核生物的启动子中有3个区域： －10区、－35区、－10与－35之间的序列。 （1）－10区 在转录起始点的上游有一个6 bp的保守序列，几乎在目前已知的所有启动子中均存在。 保守序列的中心位于转录起始点上游约－10 bp处，这一保守序列又称为－10序列。 其一致序列为TATAAT，又称Pribnow框、结合位点，在RNA聚合酶的作用下首先解链。 （2）－35区 在转录起始点上游－35 bp处，有另一个保守序列，称为－35序列。其保守序列为TTGACA， RNA聚合酶的σ因子可以识别该位点，所以称为识别位点，又称为Sextama框。 RNA聚合酶首先与识别位点结合，然后与结合位点相互作用。 该区域是启动子强弱的决定因素。 （3）－10区与－35区间的距离 －35区和－10区之间的距离在绝大多数原核生物中启动子为16到18 bp。该区域的碱基序列并不重要，但该距离的长短是至关重要的。 适宜的距离可以为RNA聚合酶提供合适的空间结构，便于转录的起始。 （二）真核生物的启动子 真核生物有三种RNA聚合酶，每一种酶都有自己的启动子，分别称为Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型启动子。 1. RNA聚合酶Ⅰ启动子的结构 RNA聚合酶Ⅰ的启动子主要由两部分组成的： 核心启动子（core promoter）位于－45至＋20的区域内，足以使转录起始。 上游调控元件（upsream control element）位于－180至－107，可提高转录起始效率。 2. RNA聚合酶Ⅱ启动子的结构 RNA聚合酶Ⅱ主要负责编码蛋白质和部分核内小rRNA（snRNA）的基因的转录，其启动子结构最为复杂。 RNA聚合酶Ⅱ单独并不能起始转录，必须和其他的辅助因子共同作用形成转录起始复合物才能起始转录。 3. RNA聚合酶Ⅲ启动子的结构 RNA聚合酶Ⅲ 转录5S rRNA、tRNA和部分snRNA。这三种启动子的结构是不同的，RNA聚合酶Ⅲ也必须和其他的辅助因子共同作用，才能识别不同的启动子。 5S rRNA和tRNA基因的启动子位于转录起始点的下游，称为内部启动子（internal promoter）。snRNA基因的启动子位于转录起始点的上游，和其他基因的启动子比较相似。 （三）转录因子 转录因子 （transcription fac