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分子生物学期末考试复习 题型：名词解释（英文）、选择、判断、简答、设计性问答（最后一节） 第六章 DNA和RNA结构 1、DNA构建模块（DNA building blocks）： 碱基（Base） 、 核苷酸（Nucleoside） 。 核苷酸 是DNA基本的构建模块。 2、DNA的全称： 脱氧核糖核酸 3、DNA的4种碱基：嘌呤（Purines）：Adenine (A)、Guanine (G) 嘧啶（Pyrimidine）：Cytosine (C)、Thymine (T) 碱基具有形成异构体的能力 是DNA合成时出错的普遍来源。 DNA的结构特点： 一条DNA分子是由2条 反向平行 的多核苷酸链相互旋转形成的双螺旋结构。 以 磷酸二酯键 为基础构成规则的不断重复的糖磷酸骨架组成的多核苷酸链。 双螺旋的两条链具有 互补 的序列， 方向相反 。 决定DNA双链稳定性的因素： ①氢键贡献于双螺旋的热动力学稳定性； ②双螺旋堆积时碱基间的相互作用（π-π共轭）对双螺旋的稳定性起重要作用。 6、DNA双螺旋有大沟和小沟（Minor and Major grooves），这是由碱基对的空间几何结构所决定的。 大沟（Major groove）富含丰富的化学信息。 7、双螺旋的多重构象：A型（RNA双螺旋与其类似，右手螺旋） B型（最接近生理状态，右手螺旋） Z型（左手螺旋） 8、变性（Denaturation）：当DNA溶液温度高于生理温度（接近100℃）或者pH较高时，互补的两条链就会分开，这一过程称为变性。 杂交（Hybridization）：两条不同来源的单链DNA或RNA通过碱基互补配对形成双链杂交分子的过程。 复性（Annealing/renature）：当变性的DNA热溶液缓慢降温，DNA的互补链又可重新聚合，形成规则双螺旋，称为复性。 熔点（Tm (melting point)）：吸收值增加到最大值一半时的温度。 9、DNA超螺旋结构的解除是靠 拓扑异构酶 实现的。 10、RNA的不同种类及作用： ①mRNA作为基因和蛋白质合成机器的中间体； ②tRNA作为mRNA上密码子与氨基酸的适配器； ③通过序列互补，RNA作为监管分子绑定到和干扰特定mRNA的翻译，或者作为指导一些后转录过程的识别因子。 ④RNA能形成复杂的三级结构。某些具有三级结构的RNA可以作为酶在细胞中催化一些特定反应（RNA核酶，如： RNase P 和 自剪接内含子 ）。 11、RNA螺旋在局部以 柄-环结构 存在互补序列间形成碱基配对区。 有三种类型：发夹结构（Hairpin）、凸结构（Bulge）、环结构（Loop） DNA的复制（replication） 1、DNA合成（synthesis） 底物（substrates）： 四种脱氧核苷三磷酸（dNTPs） 、 引物-模板接头 方向：通过引物3’端的延伸进行合成 动力来源： 焦磷酸（PPi）水解 2、DNA聚合酶（Polymerase (Pol)）通过 1 个活性位点来识别4种dNTPs，催化DNA合成。 3、DNA聚合酶的3个结构域及其功能 （1）手掌域（palm domain） ①包括2个催化位点：一个用于增加dNTPs，一个用于移除错误配对的dNTPs。 ②聚合位点：结合二价金属离子，改变催化位点周围的化学环境，促进催化； 通过与新合成的DNA小沟中的碱基形成大量的氢键来检查最新添加的核苷酸碱基配对的准确性。 ③核酸外切酶位点（Exonuclease site）/ 校正位点（proofreading site） （2）手指域（finger domain） ①结合引入的dNTP，并将正确配对的碱基包围在催化的位置上。 ②弯曲模板以仅使催化位点上引物后第一个模板碱基暴露。 ③稳定焦磷酸。 （3）拇指域（thumb domain） ①并不直接与催化相关联； ②维持引物和活性部位的正确位置以及帮助维持DNA聚合酶与其底物之间的紧密连接。 4、DNA聚合酶Ⅲ合酶的组成成分： 2个τ蛋白 、 γ复合体（滑动夹装载器） 、 滑动夹 、 聚合酶III核心酶 和 2个柔性接头 。（2个拷贝的DNA聚合酶Ⅲ核心酶和一个γ复合体） 5、DNA聚合酶的延伸能力（processivity）：每次酶与接头结合时所添加的核苷酸的平