cycle整理的MS遇到的问题.doc

cycle整理的MS遇到的问题，供自己参考 ?(2011-06-14 11:34:43) 转载▼ 标签：? it 有些问题感觉回答的不是很准确，但是大家要是有疑问，可以在后面跟帖！共同讨论！前段时间看见cycle在论坛上发的Materials-Studio?论坛问答全集觉的值得再次拿出来和大家分享Materials-Studio 论坛问答全集（精选众多论坛讨论贴）1、问：用MS构造晶体时要先确立空间群,可是那些空间群的代码是啥意思啊,看不懂,我想做的是聚乙烯醇的晶体,嘿嘿,也不知道去哪可以查到它的空间群答：A、要做晶体，首先要查询晶体数据，然后利用晶体数据再建立模型。晶体数据来源主要是文献，或者一些数据库，比如CCDC。你都不知道这个晶体是怎么样的，怎么指定空间群呢？要反过来做事情哦：）B、我不知道你指示的代码是数字代码还是字母代码,数字代码它对应了字母的代码，而字母的代码它含盖了一些群论的知识(晶系,对称操作等),如果要具体了解你的物质或者材料属于那一个群，你可以查阅一下相关的手册,当然你要了解一些基本的群论知识.MS自带了一些材料的晶体结构,你可以查询一下.2、问：各位高手，我用ms中的castep进行运算。无论cpu是几个核心，它只有一个核心在工作。这个怎么解决呢？答：请先确认以下几个问题：1，在什么系统下装，是否装了并行版本。2，计算时设置参数的地方是否选择了并行。3，程序运算时，并不是时时刻刻都要用到多个CPU3、问：我已经成功地安装了MS3.1的Linux版本，串行的DMol3可以成功运行。但是运行并行的时候出错。机器是双Xeon5320(四核)服务器，rsh和rlogin均开启，RHEL4.6系统。其中hosts.equiv的内容如下：localhostibm-consolemachines.LINUX的内容如下：localhost:8现在运行RunDMol3.sh时，脚本停在??????$MS_INSTALL_ROOT/MPICH/bin/mpirun $nolocal -np $nproc $MS_INSTALL_ROOT/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe $rootname$DMOL3_DATA这一处，没法执行这一命令并行运算时，出现以下PIxxxx(x为数字)输出ibm-console 0 /home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exelocalhost 3 /home/www/MSI/MS3.1/DMol3/bin/dmol3_mpi.exe请问这是什么原因？谢谢！答：主要是rsh中到ibm-console的没有设置把/etc/hosts改为???????????????localhost.localdomain localhost ibm-console在后面加个ibm-console也希望对大家有帮助!4、问：在最后结果的dos图中,会显示不同电子spd的贡献,我想问的是,假设MS考虑的原子Mg的电子组态为2p6 3s2,那么最后的dos结果中的s,p是不是就是2p,跟3s的贡献.比如更高能量的3p是否可能出现在dos中?如果可能的话，在这种情况下,如何区分2p和3p的贡献,谢谢.答：A、取决于你的餍势势里面没有3p电子，DOS怎么会有呢？自然，你的1p1s也不会出现在你的DOS中。B、我觉得原子没有d轨道但是计算出来的DOS图上有d轨道的贡献，这可能是电子跃迁所引起的，虽然按照教科书上的d轨道上没有电子，但是不排除有电子跃迁过去，但及时跃迁也应该只是很少的而且一般也都是这样。C、我考虑的是dos并非指电子出现的几率,而是能级的密度.3p构成导带能级不可能吗?没有d电子出现d的贡献可以理解是跃迁过去,那是不是也不否认3p的可能?既然不可能有3p,怎么会有1s1p?毕竟一开始计算中已经做了近似?D、第一性原理计算高于费米面的能带本来就不怎么可靠的。现在，计算的带隙小于实验值，很大的原因就来源于价带计算不准。p能量高于s不太好理解这里有成键反键的因素p的反键是有可能小于s的成键的另外有时候原子电子组态没有d电子的时候计算结果也出现了d轨道估计是做轨道投影的问题。vasp就有这个问题，但是可以消除这个错误的。5、问：那位高手能够介绍一下MS中CASTEP的势能模型的适用范围？比如说LDA的（PWC,VWN），GGA的（PW91,BP,PBE,BLYP,BOP,VWN-BP,PRBE,HCTH），能够简述一下其大致差别更好答：LDA局域密度近似（LDA）：局域密度近似（LDA）是第一阶梯。它仅仅采用空间点r处的电子密度n（r）