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类芽孢杆菌B69羊毛硫抗生素elgicins的分离鉴定及相关基因簇的分析
浙江大学
硕士学位论文
类芽孢杆菌B69羊毛硫抗生素elgicins的分离鉴定及相关基因簇
的分析
姓名:滕毅
申请学位级别:硕士
专业:微生物学
指导教师:吴雪昌
鉴定及相关基因簇的分析
????????基因簇,
反向高效液相色谱三步分离纯化,最后获得?鲎榉荩?直鹈??猠???
????蚭?????渲衑???
个不同组份的混合物,分别命名为?????蚭?????>?势撞舛ǎ珽???
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首先,我要衷心地感谢我尊敬的导师吴雪昌老师在我硕士期间对我的悉心指
导和关怀。本研究从开题、构思、实验设计以及论文撰写,都倾注了吴老师无数
的心血。吴老师严谨的治学态度,对科学研究的激情与执著,一丝不苟的工作态
度,以及豁达的人生观将会深深地影响我以后的生活和工作。在硕士求学阶段能
够认识这样一位导师,真的是我这辈子莫大的荣幸。在此谨向吴老师致以最崇高
同时,我还要深深地感谢伴随我度过硕士生活的各位实验室的兄弟姐妹。钱
朝东、李欧、王品美、池小琴、文艳苹、丁锐、郑道琼、方海环、朱亮、陈亚敏、
沈小波、陶香林、刘天拮、赵文鹏、鲁翠、陈杰、刘傲等,是你们给予我热情的
帮助与关心,是你们营造了良好的实验室科研氛围,才能使我顺利的完成了科研。
在此,特别要感谢钱朝东师兄在实验设计,操作、论文修改等多方面的指导与帮
英文缩略词???????
?
天然产物及其衍生物的发现是新药研发的重要基础,目前,已经有很多这样
然而,在非自然条件下,微生物中很多编码次级代谢产物的基因簇是保持沉
默的。在细菌和真菌中有关次级代谢产物合成的基因簇数目远远大于实验室条件
下实际合成的天然产物的数目??。毫无疑问,这些沉默的基因簇是发现活性药
物组分的巨大资源库。曲霉属是分离次级代谢产物非常丰富的资源【Ⅲ;每种曲霉
????,??和非核糖体多肽合
酶???????
培养条件下能够表达的仅仅不到这些基因簇的?%【?】。
??.?镜谺??检索
??????的??【????篍????的?虲结构域序列作为引导序
?.
即
?,构成了三个完整的模块
??瓵?甈?珻?瓵?甈?虲?瓵?甈?和一个缺少?结构域的模块??瓵?。
?、?和?结构域的预测底物分别为??缬氨酸????堪彼?、?蚑?
?野彼?,??淼孜锇被?嵛粗?表??????鞍状嬖?个结构域,即
?.?甤?瓵?甈?甤??渲蠥?峁褂虻奶匾煨缘孜镌げ馕??姿瞻彼?。在??
??编码的蛋白产物含有?鼋峁褂颍?直鹗茿?甈?瓹?瓵?甈?瓻.?.?,其中
?和?结构域的特异性底物预测结果分别是??蚔?,但并没有预测到?
结构域的特异性底物。??中的?.?与??的?结构域可能构成完整的一
个模块,除此之外还包括一个完整的模块??瓵?甈?。??中包含一个差向
异构酶结构域???????,?,暗示了相应的氨基酸??墓剐涂赡苁荄型。
起到了释放多肽链的作用【?】。
化【?。类似这些修饰是很难被预测的。???虼毓舶??个模块,在很大程度
簇表达产物的结构解析会有很大的帮助。
????
图?????虼亍?、???虼亟峁够?虻淖槌桑籅、非核糖体合酶??,??和??
各功能结构域。
?甀
??????????????
??.
表?????虼刂蠥结构域底物特异性预测分析
??.??基因簇概况分析
通过保守序列比对发现在????
命名为???虼亍P蛄蟹治霰砻鞲没?虼睾??个结构基因,即??、??、
?
????
两个未知的结构域。??也包含?鼋峁褂颍?碢?甂??.?,?与?之间
也存在一个未知的结构域。??存在?个结构域,也就是
构域之间存
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