植物基因组领域重要文章.docVIP

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植物基因组领域重要文章植物基因组领域重要文章

植物基因组领域重要文章 花了一个周末加一个半天,根据记忆整理了我认为重要的植物基因组领域的一些重要或者说有趣的文章,大家如果都读过,而且能讲个一二三,那恭喜你三把斧头至少已经有一把在手了. 需要说明的,这仅是一家之言,而且整理之时并没有去读文章,对文章的推荐仅是凭之前读过的印象,所以错误在所难免.请大家辨证参考.当然,我也无法保证这真的是经典,呵呵. 一共分为13个领域,推荐了140篇文章,就当寒假作业好了,呵呵.欢迎指正补充.(注:因为是基因组,所以暂没有把功能基因组的内容包括进来) 植物基因组学研究我感兴趣的几个领域 1.基因组的结构和变异 2.分子标记连锁图谱构建和基因定位 3.QTL定位的原理和方法 4.QTL精细定位 5.基因和QTL的克隆 5.1插入突变方法 5.2图位克隆的方法(含比较图位克隆) 5.3候选基因法 6.资源评估和利用 7.分子标记辅助选择(含分子设计育种) 8.转基因 8.1转基因体系和实证研究 8.2转基因的生态学安全研究 9.比较基因组 9.1标记水平的比较研究 9.2序列水平的比较研究 9.3性状水平的比较研究 9.4功能比较研究 10.杂种优势研究 10.1遗传学解释 10.2分子生物学解释 11.分子进化(主要是玉米进化) 12.基于连锁不平衡的关联分析 12.1实证研究 12.2方法学研究 13.基因组研究中的一些新技术运用 13.1DNA芯片技术 13.2 DNA shuffling 13.3 Gene Trap 13.4 Gene therapy in plants 13.5 TILLING 技术 1.植物基因组的结构和变异 在越来越多的植物基因组被测完后,该研究的重要性逐渐显现,该方面的文章可以说是汗牛充栋.在玉米方面该领域的大牛是 Buckler,ES; Messing, J, Dooner HK, Doebley J ; Gaut, BS. 1. Buckler, E. S., Gaut, B. S. and McMullen, M. D. (2006)Molecular and functional diversity of maize. Curr. Opin. PlantBiol. 9, 172-176 这是关于玉米基因组结构的REVIEW文章,先了解大概,在细读研究文章.其任何2个玉米自交系之间的遗传变异大于人和大猩猩之间的差异的经典论断充分说明玉米变异的广泛性.最近因为人类基因组研究的进展而似乎可以改写. 2.Messing J, Dooner HK. Organization and variability of themaize genome. Curr Opin Plant Biol. 2006 Apr;9(2):157-63 两位大牛的联合REVIEW, 值得一读. 3.Goff S A, Ricke D, Lan T H, Presting G, Wang R, Dunn M,Glazebrook J, Sessions A, Oeller P, Varma H, Hadley D, Hutchison D,Martin C, Katagiri F, Lange B M, Moughamer T, Xia Y, Budworth P,Zhong J, Miguel T, et al. A Draft Sequence of the Rice Genome Oryzasativa L. ssp. japonica. Science, 2002, 296: 92-100 大家或许都知道这篇文章,但我相信看完的不多,尽管全基因组测序的文章许多,强烈建议大家读这篇,讨论写的太好了.同期中国测序的文章就相形见拙许多,当然之后水稻精细图谱的公布,这篇文章也可以读读. 4. International Rice Genome Sequencing Project. The map-basedsequence genome. nature, 2005, 436: 793-800 5.Fu H H, Dooner H K. Intraspecific violation of geneticcolinearity and its implications in maize. Proc Natl Acad Sci USA,2002, 99: 9573-9578 改文章给我的启示许多,基因的存在和缺失也是等位基因的一种形式就是其一,尽管后来该文章的结论不断被修正. 6.Song R, Messing J: Gene expression of a gene family in maizebased on noncolinear haplotypes. Proc Natl Acad

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