基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因.docVIP

基于人类信号转导网络与Toll样受体信号通路挖掘心血管疾病风险基因 侯敏 徐松 杜悠雯 黄昊 李琬 陈丽娜 【摘要】 目的 挖掘潜在的心血管疾病（CVD）风险基因，为疾病的预防、诊断和治疗提供一定的参考作用。 方法 根据人类信号转导网络、CVD密切相关的toll 样受体（TLR）信号通路以及相关的表达谱信息，以网络motif及其包含的基因为研究对象，采用基因芯片显著性分析、网络motif筛选以及基因功能富集分析等方法对候选基因进行分析。结果 经分析结果得到21个潜在的CVD疾病风险基因，并且，通过文献证实，其中有12个为CVD相关的风险基因，由此可见，本研究采用的研究方法是有效的。结论 对我们所发现的潜在CVD风险基因进行深入研究，对阐明CVD的发病机制有重要的生物学意义。 【关键词】心血管疾病；Toll样受体；信号转导网络；风险基因 基金项目：哈尔滨医科大学大学生创新创业训练基金（2012-071HMU），国家自然科学基金,， 黑龙江省自然科学基金（F201237）。 作者单位：150081，哈尔滨医科大学生物物理教研室 通信作者：陈丽娜，电话：0457E-mail:chenlina@ Finding CVD related risk genes based on Human Signaling Transduction Network and TLR Signaling Network HOU Min, XU Song, DU You-wen, HUANG Hao, LI Wan, CHEN Li-na. Department of Biophysics, Harbin Medical University, Harbin 150081,China. Corresponding author: Chen Li-na, E-mail: chenlina@ 【Abstract】Objective The purpose of this paper is to find the potential risk genes of Cardiovascular Disease(CVD),which will provide some reference for the prevention、diagnosis and treatment of CVD. Methods According to the Human Signaling Transduction Network, TLR Signaling Pathway and a related expression profile data, the network motif and its genes were taken as the research object, the methods of Significance Analysis of Microarrays, Motif Screening and Gene Set Enrichment Analysis(GSEA) were adopted to analyse the candidate genes. Results 21 potential risk genes of CVD were found, 12 of which were confirmed as CVD related risk genes by references, which shows our strategy is dependable. Conclusions Biologically speaking, the further study of the potential risk genes of CVD we have found is important to clarify the mechanism of CVD. 【Key words】CVD; TLR; Signaling transduction network; Risk genes 心血管疾病（Cardiovascular Disease，CVD）是目前人类最常见的复杂疾病之一，也是发病率最高的一类疾病，其致病机理涉及多方面因素 [1-2]。目前普遍认为CVD与巨噬细胞中脂质代谢障碍密切相关[3]，脂质代谢障碍引起动脉管壁变脆、变硬，管腔变窄，形成动脉粥样硬化[4]；泡沫细胞是动脉粥样硬化斑块内出现的特征性病理细胞[5-6]，在CVD的发病初期，有大量巨噬细胞转变为泡沫细胞，形成脂质条纹甚至脂质斑块，继而引发各种症状。但是，动脉粥样硬化的发病机理尚不完全清楚，仍然需要继续探索。